基于分子对接技术靶向PPARγ的降糖药物虚拟筛选

目的： 筛选出特异性靶向PPARγ的配体，为降糖药物的研发提供思路。方法： 以核受体PPARγ配体结合区域的晶体结构作为靶点，运用Schrodinger分子对接技术虚拟筛选Drugbank中老药分子化合物，结合打分值以及化合物与靶蛋白受体的相互作用模式优化筛选结果，获得具有降糖潜在活性的小分子化合物。结果： 经过SP和XP两轮筛选得到7种化合物，结合模式与晶体中的原配体罗格列酮基本一致，化合物伸展姿势与整个口袋形状可以较好地相互匹配，而且对接打分都明显优于罗格列酮，进而比较了配体效力，化合物分子与结合口袋中氨基酸残基形成的氢键数目和对接能量值，显示艾曲波帕和雷替曲塞两个化合物表现最优。结论： 来源于Drugbank老药库中的7种化合物具有潜在靶向PPARγ的活性，从而发挥降血糖作用，其中艾曲波帕和雷替曲塞可优先选择进行降糖药物的研究。