中国2007-2009年HIV-1耐药基因型检测质量评估结果 |
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引用本文: | 邢辉,廖玲洁,钟平,李敬云,尚红,康来仪,杨娟,陈彬,全宇,赵全璧,汪宁,邵一鸣. 中国2007-2009年HIV-1耐药基因型检测质量评估结果[J]. 中国艾滋病性病, 2012, 0(4): 206-209,217 |
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作者姓名: | 邢辉 廖玲洁 钟平 李敬云 尚红 康来仪 杨娟 陈彬 全宇 赵全璧 汪宁 邵一鸣 |
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作者单位: | 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心传染病国家重点实验室;上海市疾病预防控制中心;军事医学科学院;中国医科大学 |
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基金项目: | 国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治项目(2008ZX10001-004和2012ZX10001-002);国家传染病重点实验室项目(2011SKLID102)~~ |
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摘 要: | 目的对2007-2009年统一发放至各省,针对艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)蛋白酶和反转录酶基因的耐药突变基因型外部质控品的检测结果,进行分析和检测技术能力评价。方法对3年共5次由各省提交的,应用实验室自建方法(In house)、Viroseq(雅培公司,Abbott)和TruGene(西门子公司,Siemens)检测系统获得的耐药基因型数据进行综合分析。质控盘由6份血浆(HIV-1B及B/C重组毒株)组成,覆盖病毒的蛋白酶和反转录酶基因区的野生型和耐药突变型。每份序列与共享序列比较,使用扣分制对各实验室的结果进行评价。结果除3家核心实验室外,累计有19个省23家省市级疾病预防控制中心(CDC)或医院自愿参加,共提交了95份结果,其中3家实验室使用ViroSeq检测系统;提交了9份结果;1家使用TruGene检测系统;提交了1份结果;其余85份使用in-house检测系统。考核品总的序列阳性率(获得合格序列率)为97.7%,其中的低载量(1 000拷贝/mL)样本均得到阳性结果;根据累计提交的序列结果看,耐药位点判读的完全一致率为78.9%(75/95),序列编辑分析的一致率也有76.8%(73/95)。参加能力验证的省市级实验室由2007年的15家增加到2009年下半年的23家,合格率(001PT)由73.3%上升到(004PT)95.2%,3次以上优秀的实验室有13家。结论目前的检测方法均可成功扩增中国主要亚型流行毒株。所有检测结果在各实验室间的一致性均较高,因此基因型耐药检测技术是可靠的,但各实验室检测能力也存在差异。我国具备耐药基因型检测能力的实验室数量不断增加,检测水平逐年提高。
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关 键 词: | 艾滋病病毒Ⅰ型 基因型耐药 序列 质量控制 能力验证 |
Evaluation of proficiency of HIV-1 drug resistance genotyping testing in three consecutive years in China |
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Affiliation: | XING Hui,LIAO Ling-jie,ZHONG Ping,et al.(State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control,and National Center for AIDS/STD Control and Prevention,Chinese Center for Disease Control and Prevention,Beijing 102206,China) |
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Abstract: | |
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Keywords: | HIV-1 Genotypic resistance Sequence Quality control Proficiency testing |
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