| 肝细胞癌基因表达谱分析 |
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| 引用本文： | 张宝,唐锴鹰,孙世强,刘坤,冯春琼,吴清华,陈虎,郑文岭,马文丽.肝细胞癌基因表达谱分析[J].中华肿瘤防治杂志,2012,19(17):1326-1330. |
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| 作者姓名： | 张宝 唐锴鹰 孙世强 刘坤 冯春琼 吴清华 陈虎 郑文岭 马文丽 |
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| 作者单位： | 1. 南方医科大学基因工程研究所,广东广州,510515
2. 华南理工大学软件学院,广东广州,510641 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(项目编号：81272483),广东省科技计划资助项目:生物医药高通量数据分析服务平台建设(项目编号：2010A040302003)非小细胞肺癌靶向药物应用基因检测试剂盒的研制(项目编号：2011B031800163) |
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| 摘 要： | 目的:通过分析肝细胞癌(HCC)基因表达谱改变来探讨HCC发病机制.方法:从GEO数据库中下载HCC基因表达数据GSE14215和GSE29217,采用Genespring 11.0软件分析差异表达基因,运用统合分析(meta-analysis)方法确定共同差异表达基因,利用DAVID、KEGG、String和FABLE等生物信息学软件确定相关的生物学过程、分子功能、相互作用通路等.结果:HCC组织与正常肝组织相比,共同下调、上调的差异表达基因分别是281和227个,其中作为转录因子36个；与文献报道的HCC相关基因一致的有181个.差异表达基因主要与细胞周期调控、代谢调节、药物代谢酶系、DNA的损伤复制、p53和过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路(PPAR)等信号通路有关.结论:HCC基因表达谱数据分析表明,细胞周期紊乱主要发生在S、M期；转录因子FOXM1/HNF3高表达与HCC的细胞周期紊乱密切相关.
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| 关 键 词： | 癌 肝细胞 基因表达谱 计算生物学 细胞周期 转录因子 |
Analysis of gene expression profile on hepatocellular carcinoma |
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| Keywords: | |
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