| 黄芩MYB转录因子家族全基因组鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 王晓童,向丽,邬兰,高冉冉. 黄芩MYB转录因子家族全基因组鉴定与分析[J]. 世界中医药, 2022, 0(13) |
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| 作者姓名： | 王晓童 向丽 邬兰 高冉冉 |
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| 作者单位： | 1 中国中医科学院中药研究所/青蒿素中心，北京，100700； 2 东北林业大学生命科学学院，哈尔滨，150040 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金委-贵州喀斯特中心项目（U1812403-1）；国家重点研发计划项目（2019YFC1711100） |
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| 摘 要： | 目的:黄芩中主要活性成分黄酮类化合物的生物合成途径已解析，但相关调控机制研究薄弱。本研究基于黄芩全基因组对SbMYB转录因子进行系统鉴定和分析，筛选可能参与黄酮类化合物生物合成的候选SbMYB家族成员。方法:通过HMMER和BLAST筛选SbMYB转录因子；采用IQ-TREE、ExPASy、GSDS、TBtools、Cytoscape等在线工具和软件对SbMYB家族的进化关系、基因结构、基因表达模式、蛋白调控网络等进行生物信息学分析。结果：全基因组水平上共鉴定到146个SbMYB转录因子，分为4个亚族和1个未分族成员，R2R3-MYB亚族成员最多（116个）；SbMYB基因结构较为保守，随机分布在9条染色体上；同一亚族有相似的MYB保守结构域和基序组成；SbMYB在根、茎、叶中具有相似的表达模式，与花中差异较大；SbMYB与黄酮合成相关结构基因的蛋白质-蛋白质相互作用分析筛选到43个SbMYB可能调控黄酮合成途径关键酶。结论:MYB转录因子调控植物次生代谢合成，本研究系统分析黄芩MYB转录因子家族并筛选可能参与黄酮类化合物生物合成的候选基因，为其调控机制研究奠定基础。
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| 关 键 词： | 黄芩；MYB转录因子；黄酮类化合物；基因调控网络 |
| 收稿时间： | 2022-05-10 |
Genome-wide Identification and Analysis of MYB Transcription Factor Gene Family in Scutellaria baicalensis |
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| WANG Xiaotong,XIANG Li,WU Lan,GAO Ranran. Genome-wide Identification and Analysis of MYB Transcription Factor Gene Family in Scutellaria baicalensis[J]. World Chinese Medicine, 2022, 0(13) |
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| Authors: | WANG Xiaotong XIANG Li WU Lan GAO Ranran |
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| Affiliation: | 1 The Artemisinin Research Center,Institute of Chinese Materia Medica,China Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100700,China; 2 College of Life Sciences,Northeast Forestry University,Harbin 150040,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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