| 基于多平台数据胆管癌关键差异基因筛选研究 |
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| 引用本文： | 李医明,刘洪涛,王福荣. 基于多平台数据胆管癌关键差异基因筛选研究[J]. 临床军医杂志, 2020, 48(3): 257-259,263 |
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| 作者姓名： | 李医明 刘洪涛 王福荣 |
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| 作者单位： | 北部战区总医院和平院区 普外科,辽宁 沈阳,110003 |
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| 摘 要： | 目的识别胆管癌致病的关键基因及信号通路,为寻找治疗靶点提供数据支持。方法利用GEO数据库的两个基因芯片数据集GSE26566和GSE76297进行差异基因的筛选,并通过DAVID数据库对其进行功能富集分析。采用STRING数据库构建了基因编码蛋白之间蛋白质-蛋白质相互作用网络,随后导入Cytoscape软件进行可视化分析。通过TCGA和The Human Protein Atlas数据库验证所筛选出的基因在转录组和蛋白表达水平上的差异。结果共筛选出5个关键差异表达基因,分别是AHSG、SERPINC1、CYP2E1、FGG及TTR,其主要的生物学过程富集在氧化还原反应、药物反应和跨膜转运等方面;信号通路富集在代谢途径、抗生素生物合成、补体途径和细胞色素P450系统等方面。结论利用生物信息学方法,通过不同数据平台的比较和验证,筛选出胆管癌差异表达的5个核心基因,并在转录和蛋白表达水平进行了验证,为胆管癌临床治疗提供了新的候选分子靶点。
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| 关 键 词： | 胆管癌 差异表达基因 生物信息学分析 |
Screening of key differential expression genes in cholangiocarcinoma based on multi-platform data |
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