| 基于TCGA数据集分析mRNA在子宫内膜癌中差异表达及对预后影响 |
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| 引用本文： | 张洁,赵曼曼,周妍. 基于TCGA数据集分析mRNA在子宫内膜癌中差异表达及对预后影响[J]. 临床军医杂志, 2020, 48(1): 59-62 |
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| 作者姓名： | 张洁 赵曼曼 周妍 |
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| 作者单位： | 沈阳市第四人民医院 妇产科,辽宁 沈阳,110013;北部战区总医院 妇产科,辽宁 沈阳,110016 |
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| 摘 要： | 目的基于TCGA数据集分析mRNA在子宫内膜癌中的差异表达,建立mRNA差异表达与子宫内膜癌预后的关联。方法提取TCGA数据库中子宫内膜癌样本的mRNA表达量及临床数据资料,采用edgeR算法比较正常组织与子宫内膜癌组织的mRNA表达量,通过mRNA差异表达和临床存活时间作生存分析,寻找对子宫内膜癌预后产生影响的mRNA。结果正常组织与子宫内膜癌组织之间共发现4 429个差异表达mRNA,从中选取前1 000个差异表达mRNA进行GO富集分析、KEGG富集分析及蛋白互作网络分析,筛选出20例hub基因。通过生存分析发现,7个差异表达mRNA(ASPM、AURKA、BUB1、CDCA8、KIF2C、TOP2A、UBE2C)与子宫内膜癌患者存活时间相关(P <0. 05)。结论正常组织和子宫内膜癌组织之间的ASPM、AURKA、BUB1、CDCA8、KIF2C、TOP2A、UBE2C 7个差异表达mRNA与子宫内膜癌患者预后相关,对mRNA在子宫内膜癌领域的研究具有参考价值。
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| 关 键 词： | 子宫内膜癌 TCGA数据集 mRNA |
Differential mRNA expression in endometrial cancer and its effect on prognosis were analyzed based on TCGA data set |
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