| 丹参转录因子SmbHLH93的克隆及表达模式分析 |
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| 引用本文： | 周宏骏,武玉翠,晋鑫鑫,饶丽华,王喆之. 丹参转录因子SmbHLH93的克隆及表达模式分析[J]. 中草药, 2014, 45(23): 3449-3455 |
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| 作者姓名： | 周宏骏 武玉翠 晋鑫鑫 饶丽华 王喆之 |
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| 作者单位： | 陕西师范大学生命科学学院, 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西 西安 710062;陕西师范大学生命科学学院, 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西 西安 710062;陕西师范大学生命科学学院, 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西 西安 710062;陕西师范大学生命科学学院, 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西 西安 710062;陕西师范大学生命科学学院, 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西 西安 710062 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(31270338);陕西省科技厅科技计划项目(2012K19-02-04);陕西学前师范学院基金(2014QNKJ078,2014QNKJ079) |
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| 摘 要： | 目的 克隆丹参碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)类转录因子SmbHLH93,并初步探究该基因的功能.方法 采用PCR和RT-PCR技术分别从DNA和cDNA水平克隆得到了SmbHLH93基因,进一步通过BD Walking获得了该基因的5'启动子区.生物信息学分析SmbHLH93蛋白的理化性质、结构特点和系统进化关系.结合启动子区分析软件和qPCR,研究SmbHLH93在丹参不同部位和环境诱导下的表达模式.结果 获得SmbHLH93基因序列954 bp和5'启动子区1 583 bp,其中开放阅读框(ORF)657 bp,有3个内含子和4个外显子,编码218个氨基酸,含有bHLH和ACT_UUR-ACR-like结构域,无跨膜区域,可能定位于细胞核.表达模式分析结果显示该基因的表达量在根中最高,茎中最低,且随着花的形成逐渐降低.光和低温诱导SmbHLH93的高表达,而水杨酸(SA)抑制其表达.结论 克隆得到丹参bHLH类转录因子新成员SmbHLH93,初步预测其参与了丹参花的发育过程和丹参次生代谢途径的调控.
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| 关 键 词： | 丹参 SmbHLH93 基因克隆 生物信息学 表达模式分析 |
| 收稿时间： | 2014-04-12 |
Cloning and expression pattern analysis of transcription factor SmbHLH93 from Salvia miltiorrhiza |
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| ZHOU Hong-jun,WU Yu-cui,JIN Xin-xin,RAO Li-hua and WANG Zhe-zhi. Cloning and expression pattern analysis of transcription factor SmbHLH93 from Salvia miltiorrhiza[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2014, 45(23): 3449-3455 |
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| Authors: | ZHOU Hong-jun WU Yu-cui JIN Xin-xin RAO Li-hua WANG Zhe-zhi |
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| Affiliation: | Key Laboratory of Medicinal Resources and Natural Pharmaceutical Chemistry, Ministry of Education, National Engineering Laboratory for Resource Development of Endangered Crude Drugs in Northwest of China, College of Life Sciences, Shaanxi Normal University, Xi'an 710062, China;Key Laboratory of Medicinal Resources and Natural Pharmaceutical Chemistry, Ministry of Education, National Engineering Laboratory for Resource Development of Endangered Crude Drugs in Northwest of China, College of Life Sciences, Shaanxi Normal University, Xi'an 710062, China;Key Laboratory of Medicinal Resources and Natural Pharmaceutical Chemistry, Ministry of Education, National Engineering Laboratory for Resource Development of Endangered Crude Drugs in Northwest of China, College of Life Sciences, Shaanxi Normal University, Xi'an 710062, China;Key Laboratory of Medicinal Resources and Natural Pharmaceutical Chemistry, Ministry of Education, National Engineering Laboratory for Resource Development of Endangered Crude Drugs in Northwest of China, College of Life Sciences, Shaanxi Normal University, Xi'an 710062, China;Key Laboratory of Medicinal Resources and Natural Pharmaceutical Chemistry, Ministry of Education, National Engineering Laboratory for Resource Development of Endangered Crude Drugs in Northwest of China, College of Life Sciences, Shaanxi Normal University, Xi'an 710062, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Salvia miltiorrhiza Bunge SmbHLH93 gene cloning bioinformatics expression pattern analysis |
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