胃癌相关基因COL1A2、FN1、COL6A3预后分析 |
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引用本文: | 姚远,李胜昔. 胃癌相关基因COL1A2、FN1、COL6A3预后分析[J]. 解剖科学进展, 2019, 25(5): 525-527,531 |
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作者姓名: | 姚远 李胜昔 |
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作者单位: | 辽宁省人民医院消化内镜中心,辽宁 沈阳,110016;辽宁省人民医院消化内镜中心,辽宁 沈阳,110016 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;辽宁省自然科学基金 |
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摘 要: | 目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采用GEO在线分析工具GEO2R分析数据,选取TOP250,输出差异表达基因,并通过在线生物信息学绘制韦恩图,获得共有差异基因;通过KM plotter数据库的应用分析COL1A2、FN1、 COL6A3与预后的关系。结果通过分析GSE2685、GSE19826、GSE79973芯片数据,共获得6个共表达基因,利用差异倍数作图,选取差异倍数在2倍以上的基因COL1A2、FN1、COL6A3进行分析,KM plotter数据库的分析显示COL1A2、FN1、COL6A3与胃癌的总生存期成负相关。结论 COL1A2、FN1、COL6A3在胃癌组织中表达高于癌旁组织,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。
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关 键 词: | 胃癌 预后 KM plotter数据库 COL1A2 FN1 COL6A3 |
The prognostic analysis of the gastric cancer related genes COL1A2,FN1 and COL6A3 |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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