不同测序方法在病原微生物鉴定中应用的研究进展

快速准确的微生物鉴定有利于指导临床治疗用药和控制传染病流行。传统病原微生物鉴定耗时且应用范围有限，越来越多测序方法被用于病原微生物研究。现从16S rRNA测序在细菌鉴定分析中的应用、18S rRNA和转录间隔区序列（internally transcribed spacer sequences, ITSs）在真菌或寄生虫等真核微生物鉴定分析中的应用、全基因组测序（whole genome sequencing, WGS）在可分离培养的单个微生物鉴定中的应用、宏基因组测序（metagenomic sequencing,MGS）在未知感染的微生物检测中的应用进行综述，以期为病原微生物的鉴定方法提供参考。