陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒基因特征分析题录 |
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引用本文: | 秦龙,张俊君,陈斌,王士峰,余鹏博.陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒基因特征分析题录[J].中华预防医学杂志,2023(9). |
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作者姓名: | 秦龙 张俊君 陈斌 王士峰 余鹏博 |
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作者单位: | 1. 咸阳市疾病预防控制中心微生物实验室;2. 陕西省疾病预防控制中心病毒病预防控制所 |
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摘 要: | 目的分析陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒(EA H1N1 SIV)的基因特征。方法采集患者咽拭子标本, 接种MDCK细胞进行病毒分离获得毒株, 采用全基因组深度测序方法获得分离株的8个基因节段序列, 通过GenBank数据库中Blast程序进行核苷酸同源性分析, 构建系统进化树, 分析病毒基因特征。结果病例咽拭子标本经实验室确诊为EA H1N1 SIV, 后分离毒株命名为A/Shaanxi-Weicheng/1351/2022(H1N1v)。同源性分析显示, 该分离株的PB2、NP、HA、NA和M基因均与A/swine/Beijing/0301/2018(H1N1)核苷酸同源性最高, 分别为98.29%、98.73%、97.41%、97.52%和99.08%。进化树显示, 该分离株属于G4基因型EA H1N1 SIV, 其中PB2、PB1、PA、NP和M基因来自pdm/09 H1N1, HA和NA基因来自EA H1N1, NS基因来自三源重配H1N1。其HA蛋白裂解位点为IPSIQSR↓G, 为低致病性流感病毒的分子特征。NA蛋白未出现与神经氨酸酶抑制剂相关的氨基酸...
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关 键 词: | 猪源甲型H1N1流感病毒 欧亚类禽H1N1猪流感病毒 基因特征 进化树 监测 |
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