北京市2019年腹泻病例中札如病毒基因特征分析

目的 了解北京市肠道门诊散发腹泻病例中札如病毒的基因型别及特征。方法 收集2019年北京市肠道门诊散发腹泻病例的粪便样本，应用实时荧光RT-PCR对样本进行札如病毒核酸检测，对阳性样本应用不同种RT-PCR方法进行札如病毒衣壳蛋白VP1区和聚合酶RdRp区部分基因片段扩增，对扩增阳性产物进行测序，应用BioEdit 7.0.9.0软件对序列进行比对，应用Mega 6.06软件构建进化树进行分析。结果 札如病毒总检出率为2.89%（44/1 522），<5岁病例的检出率为3.34%（18/539），≥5岁病例的检出率为2.64%（26/983）。衣壳蛋白VP1区基因测序成功23株，包括8个基因型（GⅠ.2型6株、GⅠ.1型和GⅡ.3型各5株，GⅠ.3型和GⅡ.5型各2株，GⅠ.5型、GⅡ.1型和GⅣ.1型各1株）；≥5岁病例占16株，GⅠ.2型构成比最高（37.50%，6/16），<5岁病例占7株，GⅠ.1型和GⅡ.3型构成比最高（均为42.86%，3/7）；每个基因型内部相似性为95.5%~100.0%，与不同年份、不同国家的人源或污水源的51株参考株相似性为92.2%~100.0%。聚合酶RdRp区测序成功25株8个基因型（9株GⅡ.P3型，4株GⅠ.P3型，GⅠ.P1型、GⅠ.P2型和GⅡ.P1型各为3株，GⅠ.P5型、GⅡ.P5型和GⅣ.P1型各为1株）；≥5岁病例占15株，GⅡ.P3型构成比最高（40.00%，6/15），<5岁病例占10株，GⅠ.P1型、GⅡ.P1型和GⅡ.P3型构成比最高（均为30.00%，3/10）；每个基因型内部相似性为94.0%~100.0%，与不同年份、不同国家的人源或污水源的39株参考株相似性为90.2%~99.1%。结论 札如病毒是北京市散发腹泻病例的病原之一，主要基因组为GⅠ和GⅡ，基因型多样且分散；≥5岁和<5岁人群腹泻病例主要基因型不同。

Gene characteristics analysis on Sapovirus from diarrhea cases in Beijing, 2019