| 基于随机森林的精神分裂症血清代谢组学研究 |
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| 引用本文： | 刘盈君,张涛,王璐,刘佳,常学润,张敬悬,薛付忠.基于随机森林的精神分裂症血清代谢组学研究[J].山东大学学报(医学版),2015(2):92-96. |
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| 作者姓名： | 刘盈君 张涛 王璐 刘佳 常学润 张敬悬 薛付忠 |
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| 作者单位： | 1. 山东大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,山东 济南,250012
2. 山东省精神卫生中心,山东 济南,250014 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81273177)；山东省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 目的探讨随机森林对精神分裂症患者和健康对照的血清代谢组学数据的分类能力,并筛选出差异代谢物。方法病例组为50例精神分裂症患者,对照组为62例健康个体,收集他们的血清进行代谢组学检测,然后用随机森林对数据进行分类,用OOB误差率估计、五折交叉验证评价分类效果,借助随机森林中变量重要性评分(VIM)获得重要的差异代谢物。结果随机森林对病例组和对照组的血清代谢组学数据分类效果较好。病例组错分率为4.0%,对照组错分率为1.6%。OOB误差率估计为2.68%,五折交叉验证ROC曲线下面积为0.99,并根据VIM筛选出15个重要的差异代谢物。结论将液相色谱-质谱代谢组学技术与随机森林相结合,能够筛选出有潜在临床应用价值的代谢物,可用于代谢组学研究。
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| 关 键 词： | 精神分裂症 代谢组学 随机森林 分类 变量筛选 |
Serum metabolic profiling of schizophrenia based on random forest |
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| LIU Yingjun,ZHANG Tao,WANG Lu,LIU Jia,CHANG Xuerun,ZHANG Jingxuan,XUE Fuzhong.Serum metabolic profiling of schizophrenia based on random forest[J].Journal of Shandong University:Health Sciences,2015(2):92-96. |
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| Authors: | LIU Yingjun ZHANG Tao WANG Lu LIU Jia CHANG Xuerun ZHANG Jingxuan XUE Fuzhong |
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| Institution: | LIU Yingjun;ZHANG Tao;WANG Lu;LIU Jia;CHANG Xuerun;ZHANG Jingxuan;XUE Fuzhong;Department of Epidemiology and Biostatistics,School of Public Health,Shandong University;Shandong Mental Health Center; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Schizophrenia Metabolomics Random forest Classification Variable selection |
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