基于生物信息分析焦亡在脑出血发病机制中的作用及临床意义

目的：使用生物信息学对脑出血（intracerebral hemorrhage,ICH）患者的血肿周围组织及对照样本的基因芯片数据进行分析，确定与ICH后细胞焦亡相关的关键分子，进一步探讨ICH的病理机制及潜在的治疗靶点。方法：GEO数据库中选取4例ICH患者血肿周围组织和对侧相应部位（白质与灰质）正常脑组织样本中差异表达基因谱数据，对差异表达基因（differentially expressed genes,DRGs）和焦亡相关基因（pyroptosis-related genes,PRGs）进行合并分析，确定差异表达的焦亡相关基因（differentially expressed-PRGs,DE-PRGs）。对筛选出的DE-PRGs进行聚类，并进行GO、KEGG和蛋白相互作用网络分析。结果：与对照组织相比，在血肿周围组织中，共发现44个DE-PRGs。GO和KEGG分析表明，这44个DE-PRGs主要富含在细胞凋亡过程、炎症反应的正调控、核因子κB通路正调控、NOD-样受体信号通路及细胞焦亡过程中。对44个DE-PRGs进行蛋白质网络分析，筛选出10个关键基因：IL-1β、CXCL...