| 基于生物信息学探讨SARS-CoV-2介导免疫炎症反应诱发动脉粥样硬化进展的潜在机制与防治中药筛选 |
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| 引用本文： | 高晟玮,薛亚然,张垚,杨继,孙艳君,张露丹,贾福运,王保和,谷旭放,黄宇虹.基于生物信息学探讨SARS-CoV-2介导免疫炎症反应诱发动脉粥样硬化进展的潜在机制与防治中药筛选[J].中草药,2023,54(8):2523-2535. |
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| 作者姓名： | 高晟玮 薛亚然 张垚 杨继 孙艳君 张露丹 贾福运 王保和 谷旭放 黄宇虹 |
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| 作者单位： | 天津中医药大学, 天津 301617;天津医科大学, 天津 300070;天津中医药大学第一附属医院, 天津 300193;天津中医药大学第二附属医院, 天津 300150 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划“中医药现代化研究”（2021YFC1712900）；国家自然科学基金项目（81873149）；国家“重大新药创制”科技重大专项资助项目（2018ZX09734002） |
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| 摘 要： | 目的 应用生物信息学技术，从免疫炎症角度探索严重急性呼吸综合征冠状病毒-2(severe acute respiratory syndrome coronavirus-2,SARS-CoV-2)感染诱导动脉粥样硬化（atherosclerosis,AS）进展的核心靶点及重要通路，进而预测潜在防治中药。方法 从基因表达数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）中获取新型冠状病毒肺炎患者和动脉粥样硬化患者芯片数据，利用“limmar”包及“Venn”包筛选2种疾病的共同差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs），对共同DEGs进行基因本体论（gene ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）分析，注释其功能及重要通路。对2组基因集进行免疫细胞和免疫功能打分，评估免疫细胞浸润水平。利用STRING数据库，构建蛋白-蛋白互作（protein-protein interaction,PPI）网络；通过Cytoscape的CytoH...
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| 关 键 词： | 严重急性呼吸综合征冠状病毒-2 动脉粥样硬化 免疫炎症反应 生物信息学 中药预测 川芎 桃仁 当归 黄芩 |
| 收稿时间： | 2022/11/23 0:00:00 |
Exploration of potential mechanism of SARS-CoV-2 induced immune inflammatory response leading to progression of atherosclerosis and prediction of traditional Chinese medicine for preventing and treating based on bioinformatics |
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| GAO Sheng-wei,XUE Ya-ran,ZHANG Yao,YANG Ji,SUN Yan-jun,ZHANG Lu-dan,JIA Fu-yun,WANG Bao-he,GU Xu-fang,HUANG Yu-hong.Exploration of potential mechanism of SARS-CoV-2 induced immune inflammatory response leading to progression of atherosclerosis and prediction of traditional Chinese medicine for preventing and treating based on bioinformatics[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2023,54(8):2523-2535. |
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| Authors: | GAO Sheng-wei XUE Ya-ran ZHANG Yao YANG Ji SUN Yan-jun ZHANG Lu-dan JIA Fu-yun WANG Bao-he GU Xu-fang HUANG Yu-hong |
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| Institution: | Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, Tianjin 301617, China;Tianjin Medical University, Tianjin 300070, China;The First Affiliated Hospital of Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, Tianjin 300193, China;The Second Affiliated Hospital of Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, Tianjin 300150, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 atherosclerosis immune inflammatory reaction bioinformatics prediction of traditional Chinese medicine Chuanxiong Rhizoma Persicae Semen Angelicae Sinensis Radix Scutellariae Radix |
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