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一种基于双重PCR结合毛细管电泳验证转录组测序结果的新方法
引用本文:易健明,高艳,李志慧,张艳春,屈武斌,张成岗. 一种基于双重PCR结合毛细管电泳验证转录组测序结果的新方法[J]. 军事医学科学院院刊, 2014, 0(9)
作者姓名:易健明  高艳  李志慧  张艳春  屈武斌  张成岗
作者单位:1. 安徽医科大学研究生院,合肥 230032; 北京放射与辐射医学研究所,蛋白质组学国家重点实验室,全军军事认知与心理卫生研究中心,北京 100850
2. 北京放射与辐射医学研究所,蛋白质组学国家重点实验室,全军军事认知与心理卫生研究中心,北京 100850
基金项目:国家重点基础研究发展计划资助项目(973计划)(2012CB518200);国家自然科学基金资助项目(31101049,31371345,31300703);国家863计划项目(2012 AA022402);航天医学基础与应用国家重点实验室2011年开放课题(SMFA12K15);中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室2011年开放课题
摘    要:目的:将双重PCR与毛细管电泳技术相结合,建立一种验证转录组测序结果的新方法。方法根据前期进行转录组测序的分析结果,挑选8个差异基因作为靶基因,分别使用双重PCR结合琼脂糖凝胶电泳、双重PCR结合毛细管电泳以及实时荧光定量PCR进行验证,比较三者的验证率。结果双重PCR结合琼脂糖凝胶电泳的验证率为50%;双重PCR结合毛细管电泳和实时荧光定量PCR的验证率均为100%。结论双重PCR结合毛细管电泳可作为转录组测序结果验证的一种有效方法。

关 键 词:转录组测序  双重PCR  毛细管电泳  实时荧光定量PCR

Combination of duplex PCR technology with capillary electrophoresis is an alterna-tive method to validate the result of transcriptome sequencing
YI Jian-ming,GAO Yan,LI Zhi-hui,ZHANG Yan-chun,QU Wu-bin,ZHANG Cheng-gang. Combination of duplex PCR technology with capillary electrophoresis is an alterna-tive method to validate the result of transcriptome sequencing[J]. Bulletin of the Academy of Military Medical Sciences, 2014, 0(9)
Authors:YI Jian-ming  GAO Yan  LI Zhi-hui  ZHANG Yan-chun  QU Wu-bin  ZHANG Cheng-gang
Abstract:
Keywords:
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