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在中国人群中鉴定发现PBX1基因为1q 23-24区域新的狼疮易感基因
引用本文:沈南,吴慧,陈顺乐,梁栋,顾越英,钱捷,鲍春德,王元.在中国人群中鉴定发现PBX1基因为1q 23-24区域新的狼疮易感基因[J].中华风湿病学杂志,2003,7(7):399-405.
作者姓名:沈南  吴慧  陈顺乐  梁栋  顾越英  钱捷  鲍春德  王元
作者单位:200001,上海第二医科大学附属仁济医院风湿科,上海市风湿病学研究所
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30000154,30271224);上海市科技发展基金资助项目(01JC14029);霍英东基金会青年教师基金资助项目(81030);863计划课题基金资助项目(2002AA229101);上海市科委启明星后计划项目(02QMB1404)
摘    要:目的用连锁不平衡(linkage disequilibrium)的方法对1号染色体狼疮易感区域进行进一步的精细定位,并由此定位新的系统性红斑狼疮(SLE)候选基因.方法用9对高密度的微卫星标记对1q23-24易感区域进行连锁不平衡分析;用延伸型传递不平衡试验(ETDT)、Gene Hunter和家系为基础的相关分析(FBAT)软件分析连锁不平衡的结果;用TaqMan荧光实时定量聚合酶链反应(PCR)检测候选基因mRNA的表达量;用等位基因分型PCR对候选基因内的4个SNP分型.结果①发现微卫星标记D1S2628 (P=0.000 987,Pc=0.001 2)和D1S2673 (P=0.007 082,Pc=0.010 4)的等位基因存在整体的显著传递不平衡);②发现D1S2628-119 bp (Pc=0.001 2;传递∶不传递=91∶45,P=0.000 1)和D1S2673-103 bp (Pc=0.010 4,传递∶不传递=109∶67,P=0.0016)等位基因从杂合子父母优势传递给受累后代;③在中国汉族红斑狼疮核心家系中单倍型D1S2628 (119 bp)-D1S2673 (103 bp) (传递∶不传递=43∶18,P=0.001 4)和单倍型D1S2628 (119 bp)-D1S2673 (107 bp) (传递∶不传递=29∶12,P=0.007 9)存在传递不平衡.在中国汉族SLE患者中PBX1的mRNA的表达量显著下降(P<0.000 1).PBX1基因中的单倍型SNP1(G)-SNP2(C)优势传递给受累后代.结论在中国汉族人群的1q23区存在与微卫星标记D1S2628和D1S2673物理距离相近的SLE易感基因;PBX1基因表达较低,其SNP单倍型与SLE易感显著相关.这提示PBX1基因可能是一个新的候选基因.

关 键 词:中国人群  鉴定  PBXl基因  1q23-24区域  狼疮易感基因  系统性红斑狼疮
修稿时间:2003年5月16日

Identification of a novel candidate gene PBX1 within the putative systemic lupus erythematosus susceptibility locus at 1q23-24 in a Chinese cohort
SHEN Nan,WU Hui,CHEN Shun le,LIANG Dong,GU Yue ying,QIAN Jie,BAO Chun de,WANG Yuan.Deptartment of Rheumatology,Renji Hospital,Shanghai Second Medical University,Shanghai ,China.Identification of a novel candidate gene PBX1 within the putative systemic lupus erythematosus susceptibility locus at 1q23-24 in a Chinese cohort[J].Chinese Journal of Rheumatology,2003,7(7):399-405.
Authors:SHEN Nan  WU Hui  CHEN Shun le  LIANG Dong  GU Yue ying  QIAN Jie  BAO Chun de  WANG YuanDeptartment of Rheumatology  Renji Hospital  Shanghai Second Medical University  Shanghai  China
Institution:SHEN Nan,WU Hui,CHEN Shun le,LIANG Dong,GU Yue ying,QIAN Jie,BAO Chun de,WANG Yuan.Deptartment of Rheumatology,Renji Hospital,Shanghai Second Medical University,Shanghai 200001,China
Abstract:
Keywords:
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