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基于网络药理学和分子对接技术探讨复方一枝蒿颗粒治疗新型冠状病毒感染的作用机制
作者姓名:施洋  陈振东  赵俊芳  樊登峰  曹永宏  候宝林
作者单位:1. 克拉玛依市中西医结合医院(市人民医院);2. 克拉玛依市中心医院
基金项目:国家重点研发计划“重大慢性非传染性疾病防控研究”重点专项定向项目(2018YFC1311900);
摘    要:目的:探究复方一枝蒿颗粒治疗新型冠状病毒感染(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的分子生物学机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台、中医药百科全书数据库及Pub Chem Compound数据库对复方一枝蒿颗粒的有效活性成分进行筛选,通过基因组注释数据库平台、Drugbank、Therapeutic Target Database数据库预测COVID-19相关疾病靶点,同时应用GEO数据库鉴定与COVID-19相关的差异表达基因。取药物活性成分靶点、疾病靶点和差异表达基因的交集,利用R语言进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,采用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用调控网络,使用Cytoscape软件构建药物-活性成分-关键靶点调控网络。此外,基于上述研究结果进行分子对接分析。结果:复方一枝蒿颗粒作用于COVID-19的有效活性成分有52个,靶标基因585个,涉及1 090个疾病靶点和5 882个差异表达基因,其中交集靶点基因有30个。GO和KEGG分析结果显示,关键靶点基因主要集中在膜...

关 键 词:复方一枝蒿颗粒  新型冠状病毒感染  网络药理学  分子对接  基因靶点
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