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| 基于游离DNA的纳米孔测序在一例肺炎病例病原识别中的应用题录 | |
| 作者姓名： | 江婷婷 林彦锋 杨朗 王凯英 李瑾慧 李璞媛 刘慧莹 李鹏 宋宏彬 |
| 作者单位： | 1. 安徽医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室;2. 解放军疾病预防控制中心;3. 解放军总医院第五医学中心呼吸与危重症医学科;4. 解放军总医院第八医学中心呼吸与危重症医学科 |
| 基金项目： | 国家重点研发计划(2021YFC2301000)； |
| 摘 要： | 目的探讨游离DNA测序在呼吸道感染病原诊断中的应用价值。方法对一例肺炎病例的支气管肺泡灌洗液和血液样本提取游离DNA, 同时进行纳米孔测序和二代测序。结果纳米孔测序从肺泡灌洗液样本中检测到132条1型单纯疱疹病毒(herpes simplex virus type 1, HSV-1)序列, 但从血液样本中未检出HSV-1序列。二代测序从两种样本中均检出HSV-1序列, 产生的病毒序列数与测序深度高于纳米孔测序。实时定量PCR反应和血清学检测证实了该诊断。纳米孔测序与二代测序数据混合组装后获得了HSV-1全长序列, 系统进化分析表明该病毒与美国分离的毒株亲缘关系最近。结论纳米孔测序技术可在更短时间内检测出病原, 有助于感染性疾病病原的快速诊断。 |
| 关 键 词： | 纳米孔测序 宏基因组测序 单纯疱疹病毒 游离DNA 病原检测 |