慢性间歇性低氧大鼠肾组织差异蛋白的定量分析：基于TMT-PRM技术

目的 基于TMT-PRM技术研究慢性间歇性低氧大鼠肾脏组织的蛋白质组学，筛选差异表达蛋白以鉴定潜在的生物标志物。方法 将20只SD大鼠随机分为正常组、实验组（n=10）。实验组放入低氧舱内建立慢性间歇性低氧（CIH）大鼠模型。12周后采集肾脏样本，HE染色观察大鼠肾组织形态变化；提取蛋白并酶解和TMT标记，采用LC-MS/MS鉴定蛋白，软件Proteome Discoverer2.4处理数据，进行生物信息学分析，以倍数变化1.2以上或低于0.83为标准，t检验P<0.05作为差异表达蛋白，并应用PRM技术验证候选蛋白的表达情况。结果 CIH引起肾脏损伤，肾小球形态不规则，肾小管上皮细胞肿胀等。实验组与正常组比较，筛选出差异表达蛋白有31种，其中表达上调的22种，表达下调的9种。GO功能富集分析显示差异表达蛋白主要参与细胞黏附、缺氧应激、钙离子等生物学过程。KEGG通路富集分析结果显示差异表达蛋白涉及PPAR、AMPK、代谢途径等信号通路。PRM相对定量分析的目标蛋白中进行筛选，P07379(PCK1)、P19132(Fth1)、Q5XI79(Ndufaf7)3个蛋白与TMT定量蛋...