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江苏省新型冠状病毒NSP1变异分析及其与临床分型的关系题录
作者姓名:吴涛  朱小娟  乔乔  迟莹  赵康辰  朱立国  吴斌  葛以跃  崔仑标
作者单位:江苏省疾病预防控制中心病原微生物研究所国家卫健委肠道病原微生物重点实验室江苏省新发突发重大传染病病原微生物重点实验室南京
摘    要:目的探讨江苏省新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)非结构蛋白1(nonstructural protein 1, NSPl)变异情况及其与临床分型的关系。方法收集2020—2022年间江苏省SARS-CoV-2感染病例的样本及基本临床信息。对样本进行高通量测序, 测序后的数据以Wuhan-Hu-1(GenBank:MN908947.3)为参考基因分析NSP1序列变异情况及其与临床分型的关系。使用DynaMut在线服务器分析突变氨基酸对蛋白质稳定性及分子柔韧性的影响。结果共收集病例样本1 241例, NSP1基因同义突变61例, 错义突变及缺失共487例, 存在氨基酸变异的患者以无症状感染者(75.4%)为主, 且病例临床分型严重程度更轻(Z=-24.8, P<0.01)。共发现NSP1蛋白出现11个非同义突变和1个缺失。N端中出现了8个稳定突变及1个失稳突变, 2个突变增加了分子柔韧性;Linker区S135R的突变使蛋白质失稳但增加了柔韧性;C端R171C突变使蛋白质稳定但降低了柔...

关 键 词:SARS-CoV-2  非结构蛋白1  变异  稳定性  临床分型
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