基于整合药理学结合GEO数据集分析开心散防治阿尔茨海默病分子机制题录 |
| |
引用本文: | 陈晶,李瑒,宋丽颖,侯志涛.基于整合药理学结合GEO数据集分析开心散防治阿尔茨海默病分子机制题录[J].国际中医中药杂志,2023(2). |
| |
作者姓名: | 陈晶 李瑒 宋丽颖 侯志涛 |
| |
作者单位: | 黑龙江中医药大学基础医学院 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金项目(81904307); |
| |
摘 要: | 目的基于整合药理学平台联合GEO芯片差异基因分析的方法, 分析开心散治疗AD的作用机制。方法通过检索中医药整合药理学研究平台(TCMIP)和Drugbank数据库, 获得开心散组方药物活性成分和相关分子靶点。通过GEO数据库获取GSE4757芯片数据, 使用R语言获取其差异基因, 绘制热图和火山图。通过Cytoscape 3.7.2构建开心散与AD的差异基因分子靶点图, 使用Bisogenet和CytoNCA绘制靶点拓扑网络, 并进行开心散与AD基因的GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果获得开心散治疗AD的活性成分86个, 与GEO共有的差异基因29个, 构建PPI拓扑网络, 筛选出核心的候选基因6个, 与KEGG通路富集基因合并, 获得治疗疾病的重要基因为CHRM1、CHRM2、ACHE、CHRM3、CASP8、PTGS2、DRD1、CACN1S、ADRB1。GO功能条目获得375条, 主要涉及血管收缩、突触后膜可塑性, 神经递质传递等。KEGG富集分析主要涉及胆碱能突触信号通路、cAMP信号通路、钙信号通路、神经-配体-受体相互作用信号通路等。结论开心散治疗AD具有多成分、多靶...
|
关 键 词: | 阿尔茨海默病 开心散 中医药整合药理学研究平台 GEO数据库 分子对接模拟 |
|
|