微小扇头蜱Enolase基因序列特征及其编码蛋白结构与抗原表位预测

目的 分析微小扇头蜱Enolase基因序列特征，并预测其所编码Enolase蛋白二、三级结构及抗原表位。方法 2022年6月25日在湖南省怀化市芷江县某黄牛养殖场采集62只雌性饱血微小扇头蜱，提取其DNA,PCR扩增其Enolase基因，PCR扩增产物克隆、测序并表达。采用软件Clustal X分析Enolase基因序列特征，并将基因序列翻译成氨基酸序列。采用PRABI软件推导出Enolase蛋白二、三级结构，并对其理化性质进行分析；采用ABCpred Prediction、Scratch、IEDB和NetCTL软件预测Enolase蛋白B、T细胞抗原表位。结果 微小扇头蜱Enolase基因序列全长1 323 bp，碱基A、T、G、C含量分别为24.5%、22.5%、27.0%、26.0%,A+T含量为47.0%、G+C含量为53.0%。该基因共编码434个氨基酸；Enolase蛋白分子量大小为47.12 k Da，其二级结构含186个（42.86%）α-螺旋、32个（7.37%）β-转角、144个（33.18%）无规卷曲、72个（16.59%）扩展链。Enolase蛋白存在于细胞质中...