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| 河南新乡2008年手足口病病原分离鉴定及病毒基因组特征 | |
| 引用本文： | 韩剑峰,安康,刘洪,陈浩利,于曼,张勇朝,司炳银,杨再维,秦成峰,赵世方,秦鄂德,林小军,祝庆余,常国辉. 河南新乡2008年手足口病病原分离鉴定及病毒基因组特征[J]. 军事医学科学院院刊, 2008, 32(6) |
| 作者姓名： | 韩剑峰 安康 刘洪 陈浩利 于曼 张勇朝 司炳银 杨再维 秦成峰 赵世方 秦鄂德 林小军 祝庆余 常国辉 |
| 作者单位： | 1. 军事医学科学院微生物流行病研究所,病原微生物与生物安全国家重点实验室,北京,100071 2. 华兰生物工程股份有限公司,河南新乡,453000 3. 河南省新乡市疾病控制中心,河南新乡,453000 |
| 摘 要： | 目的:对2008年分离自河南新乡手足口病患者粪便标本的病原进行分离鉴定及全基因组序列测定,并同相关毒株序列进行同源性比对和进化分析,以了解新分离病毒基因组序列特征及可能的传播来源.方法:将手足口病患者粪便标本接种敏感细胞进行分离传代培养,制备抗原片进行间接免疫荧光检测,采用特异性引物进行PCR鉴定,将病毒基因组分为8个片段进行RT-PCR扩增,扩增产物纯化后进行PCR测序.通过末端重叠序列拼接成全长病毒基因组序列,利用生物信息学软件对序列进行比对分析,绘制进化树.结果:测序获得的3株EV71病毒基因组全长均为7 405 nt,VPI氨基酸序列同源性达100%.Blast分析表明F3(F8)-Henan-08毒株均与安徽阜阳2008年分离的EV71毒株同源性最高,而F4-Henan-08毒株与我国台湾省2004年分离的EV71毒株同源性最高.序列进化分析表明,新分离毒株属于C4基因亚型.结论:新分离的河南EV71毒株与安徽阜阳分离的毒株可能具有相同来源. |
| 关 键 词： | 手足口病 EV71病毒 基因组 序列测定 进化分析 |
Identification and genomic characteristics of enterovirus type 71 isolated from Xinxiang,Henan,in 2008 |
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| HAN Jian-Feng,AN Kang,LIU Hong,CHEN Hao-Li,YU Man,ZHANG Yong-Chao,SI Bing-Yin,YANG Zai-Wei,QIN Cheng-Feng,ZHAO Shi-Fang,QIN E-De,LIN Xiao-Jun,ZHU Qing-Yu,CHANG Guo-Hui. Identification and genomic characteristics of enterovirus type 71 isolated from Xinxiang,Henan,in 2008[J]. Bulletin of the Academy of Military Medical Sciences, 2008, 32(6) | |
| Authors: | HAN Jian-Feng AN Kang LIU Hong CHEN Hao-Li YU Man ZHANG Yong-Chao SI Bing-Yin YANG Zai-Wei QIN Cheng-Feng ZHAO Shi-Fang QIN E-De LIN Xiao-Jun ZHU Qing-Yu CHANG Guo-Hui |
| Affiliation: | HAN Jian-Feng~1 AN Kang~2 LIU Hong~1 CHEN Hao-Li~3 YU Man~1 ZHANG Yong-Chao~2 SI Bing-Yin~1 YANG Zai-Wei~2 QIN Cheng-Feng~1 ZHAO Shi-Fang~3 QIN E-De~1 LIN Xiao-Jun~2 ZHU Qing-Yu~1 CHANG Guo-Hui~(1*) (1.State Key Laboratory of Pathogen , Biosecurity,Institute of Microbiology , Epidemiology,Academy of Military Medical Sciences,Beijing 100071,China,2.Hualan Biological Engineering,Co.Ltd,Xinxiang,Henan 453000,3.Xinxiang Center for Disease Control , Prevention,China) |
| Abstract: | Objective:To understand the genomic sequence characteristics and possible origins of enterovirus type 71 isolated from feces of patients with hand-foot-mouth disease(HFMD)in Xinxiang,Henan province,in 2008,and to make a comparison and evolution analysis between the genome sequences of three EV71 strains and ones involved.Methods:The agenomic fragments with 8 pairs of primers spanning the whole genome were amplified.The complete genome sequences were determined by PCR sequencing method,and the sequences were... |
| Keywords: | hand-foot-mouth disease enterovirus type 71 genome sequencing phylogenetic analysis |
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