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| B组轮状病毒WH-1株 NSP2基因序列和蛋白质结构分析 | |
| 引用本文： | 李维琳,唐力,王斌,唐少文,N.Kobayashi,李燕,段纪俊,杨继红.B组轮状病毒WH-1株 NSP2基因序列和蛋白质结构分析[J].中华微生物学和免疫学杂志,2003,23(11):853-857. |
| 作者姓名： | 李维琳 唐力 王斌 唐少文 N.Kobayashi 李燕 段纪俊 杨继红 |
| 作者单位： | 1. 武汉市疾病预防控制中心;华中农业大学生命科学院 2. 武汉市疾病预防控制中心 3. Department of Hygiene, Sapporo Medical University Medicine School 4. 武汉市疾病预防控制中心;中国科学院武汉病毒研究所分子病毒学重点实验室 |
| 基金项目： | 日本文部省科研基金资助 (No.12 5 760 11)，日本札幌医科大学卫生系合作项目 |
| 摘 要： | 目的 克隆成人腹泻标本WH-1中B组轮状病毒组(group Brotavirus，GBRV)非结构蛋白NSP2基因，分析其核苷酸序列，比较与其它GBRV基因同源性，预测其mRNA二级结构、蛋白质二级结构。方法利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术，从成人腹泻标本WH-1中扩增GBRV NSP2基因，克隆载体pUCmT，对NSP2基因进行核苷酸序列分析。利用GeneBee软件比较与其它GBRV毒株NSP2基因同源性，Rnaviz2．0软件绘制NSP2基因的二级结构，PredictProtein软件分析NSP2蛋白结构。结果成人腹泻标本WH-1中GBRV非结构蛋白NSP2基因全长1007bD，与ADRV核苷酸序列的同源性达98％，与印度加尔各达分离株CAI-1达82％，与IDIR(鼠)同源性仅为79％。氨基酸序列与ADRV的同源性达98．4％，与CAL-1达97．7％，而与IDIR仅为89．0％。其mRNA折叠形成多达26个发卡环状结构。NSP2蛋白是由301个氨基酸残基组成的多肽，含有2个潜在的N-糖基化位点和多个磷酰化位点。结论成人腹泻标本WH-1中GBRV非结构蛋白NSP2基因和氨基酸序列与人GBRV有较高的同源性，而与动物中GBRV同源性相对较低，其中与ADRV的同源性最高，推测GBRV WH-1株与ADRV具有相同起源。 |
| 关 键 词： | 轮状病毒 WH-1株 NSP2 基因序列 蛋白质 结构分析 |
| 修稿时间： | 2003年5月22日 |
Analysis of non-structural protein NSP2 gene sequence and protein structure of human group B rotavirus strain WH-1 |
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| N.Kobayashi.Analysis of non-structural protein NSP2 gene sequence and protein structure of human group B rotavirus strain WH-1[J].Chinese Journal of Microbiology and Immunology,2003,23(11):853-857. | |
| Authors: | NKobayashi |
| Abstract: | |
| Keywords: | Human group B rotavirus Non-structural protein NSP2 Gene cloning Sequence analysis mRNA secondary structure Protein structure |
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