不同病理类型甲状腺癌共同调控网络的转录组学整合研究

目的 对甲状腺乳头状癌（PTC）、滤泡状甲状腺癌（FTC）、甲状腺未分化癌（ATC）、甲状腺髓样癌（MTC）的共同调控网络进行转录组学整合研究，分析它们之间重要的特异调节因子和调节信号通路。方法 在基因表达综合数据库（GEO）中的高通量基因芯片数据库筛选出3个代表性数据集以形成大数据集，获得不同病理类型甲状腺癌患者间的差异表达基因（DEG），对筛选出的DEG进一步分析以筛选出共同表达的DEG。对共同表达的DEG进行基因本体（GO）功能注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，并进行蛋白相互作用网络可视化分析，识别共同调控转录因子，最后应用Kaplan-Meier法评估获得的转录因子与甲状腺癌患者预后的关系。结果 共筛选出了191个共同表达的DEG，利用生物学信息注释及可视化数据库（DAVID）共得出96项重要富集的基因功能，主要调节细胞周期和免疫调节等相关信号通路，得出5条KEGG通路，主要包括碱基切除修复、膦酸盐和次膦酸盐代谢、致病性大肠杆菌感染、癌症中的蛋白聚糖、细胞黏附分子通路。蛋白相互作用网络发现25个关键节点与蛋白-蛋白间相互作用显著关联，使用iRegulon插...