| 食管癌淋巴结转移相关基因的转录水平筛选及网络分析 |
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| 引用本文： | 冯飞跃,邱斌,李春晓,钱海利,高树庚. 食管癌淋巴结转移相关基因的转录水平筛选及网络分析[J]. 癌症进展, 2017, 15(3). DOI: 10.11877/j.issn.1672-1535.2017.15.03.07 |
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| 作者姓名： | 冯飞跃 邱斌 李春晓 钱海利 高树庚 |
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| 作者单位： | 国家癌症中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院胸外科,北京,100021;国家癌症中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室,北京,100021 |
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| 摘 要： | 目的 从转录组水平筛选食管癌淋巴结转移相关基因,为深入研究食管癌淋巴结转移提供线索.方法 利用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据资源,采用随机森林分类方法从转录水平分析、筛选食管癌淋巴结转移相关基因,并对其进行功能聚类.结果 获得了与食管癌淋巴结转移相关基因的相关显著性排序,分析获得的重要相关基因集的功能主要集中在细胞代谢及DNA修复、转录等的调控上,并在其中获得了与食管癌淋巴结转移密切相关的代谢及DNA调控领域中的重要节点基因.结论 Heatmap图显示获得一簇明显的淋巴结转移相关基因,聚类分析显示这些基因主要集中在代谢和DNA调控等功能上,网络分析获得了KRAS、PPM1B、PPP3CA、ATR、WRN、TOP2B等与食管癌淋巴结转移相关的重要节点基因.
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| 关 键 词： | 食管癌 淋巴结转移 转录水平 |
Screening and network analysis of the genes correlated with lymph node metastasis in esophageal cancer at transcriptional level |
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| FENG Feiyue,QIU Bin,LI Chunxiao,QIAN Haili,GAO Shugeng. Screening and network analysis of the genes correlated with lymph node metastasis in esophageal cancer at transcriptional level[J]. Oncology Progress, 2017, 15(3). DOI: 10.11877/j.issn.1672-1535.2017.15.03.07 |
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| Authors: | FENG Feiyue QIU Bin LI Chunxiao QIAN Haili GAO Shugeng |
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