| 钦州市钦南区HIV-1流行亚型及基因变异特征研究 |
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| 引用本文： | 沈平,苏齐鉴,黄毅毅,蒋丽萍,张达燕,郭继昌,徐鸿庄,韦建立. 钦州市钦南区HIV-1流行亚型及基因变异特征研究[J]. 重庆医学, 2016, 0(26): 3605-3607. DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2016.26.002 |
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| 作者姓名： | 沈平 苏齐鉴 黄毅毅 蒋丽萍 张达燕 郭继昌 徐鸿庄 韦建立 |
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| 作者单位： | 1. 广西壮族自治区钦州市钦南区疾病预防控制中心 535000;2. 广西中医药大学附属瑞康医院,南宁,530011 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(81360258)，钦州市钦南区科技局资助项目(20140101) |
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| 摘 要： | 目的 调查流行于钦南区的HIV-1亚型种类并分析其基因变异特征.方法 抽取100例未抗病毒治疗的HIV-1感染者,从血样中提取病毒RNA或前病毒DNA,采用聚合酶链反应(PCR)扩增HIV-1 gag基因和pol基因片段并测序,用系统进化树分析其亚型,并计算gag和pol区的基因离散率.结果 97份血样获得gag基因序列或pol基因序列,4份血样的gag与pol分型不一致,其他93份分型明确,其中CRF01_AE重组型、CRF07_BC重组型、CRF08 BC重组型及G亚型分别占76.34％(71/93)、9.68％(9/93)、12.90％(12/93)和1.07％(1/93).CRF08_BC的gag基因离散率为0.059±0.005,高于CRF07_BC的0.053±0.005(P＜0.01)和CRF01_AE的0.049±0.004(P＜0.01).CRF01_AE的pol基因离散率为0.044±0.003,高于CRF07_BC的0.035±0.004(P＜0.01)和CRF08 BC的0.033±0.003(P＜0.01).结论 钦南区HIV-1存在至少3种流行亚型,其中CRF01_AE是最主要的亚型,不同基因区的变异程度有所不同.
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| 关 键 词： | HIV-1 基因,gag 基因,pol 亚型 离散率 变异 |
HIV-1 subtype distribution and genetic variation in Qinzhou South district of Qinzhou city |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | HIV-1 gene,gag gene,pol subtype genetic distance variation |
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