狼疮性肾炎相关基因的共表达网络构建与分析

目的基于基因表达综合数据库(GEO)挖掘与狼疮性肾炎(LN)相关的潜在基因。方法从GEO中搜集LN相关的样本,获得GSE32591、GSE81622、GSE99967共3个数据集。利用GEO2R平台对这3个数据集进行分析,筛选出共同差异基因,并利用在线分析工具DAVID完成GO富集分析和KEGG通路富集分析。将筛选出的共同差异基因导入STRING在线数据库,构建共同差异基因的蛋白-蛋白相互作用网络,利用Cytoscape软件进行模块分析并识别枢纽基因。结果筛选得到110个共同差异基因。GO富集分析发现这些基因主要参与了防御反应、免疫反应、对病毒的反应、对细菌的反应、对伤害的反应、炎症反应等生物学过程。KEGG通路富集分析主要包括了系统性红斑狼疮、抗原处理和呈递、补体与凝血级联、RIG-I样受体等信号通路。从最显著基因模块中识别出10个枢纽基因:RSAD2、OAS1、MX1、ISG15、DDX58、IFIH1、IFI44、IFI44L、IFIT1、IFIT3。结论生物信息学分析显示RSAD2、OAS1、MX1、ISG15、DDX58、IFIH1、IFI44、IFI44L、IFIT1、IF...