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新疆株细粒棘球蚴Innexin-unc9ORF的克隆鉴定及蛋白生物信息学分析北大核心CSCD
作者姓名:黎飞海  吴军  李军  张文宝  吴川川  杨梅
作者单位:1.新疆医科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生教研室830011;2.新疆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室;;3.新疆医科大学第一附属医院临床医学研究院省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室;
基金项目:新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(No.2017D01C197)
摘    要:目的分子克隆新疆株细粒棘球绦虫缝隙连接通道蛋白(也称内联蛋白,EgInnexin unc9,EgInx)的完整开放阅读框(ORF)并鉴定,利用生物信息学软件分析该蛋白的分子特性,为进一步研究EgInx的功能和研制犬抗细粒棘球绦虫疫苗奠定基础。方法从新疆株细粒棘球蚴中扩增EgInx-ORF全长,克隆到pMD20-T上并测序;利用Expasy ProtParam、ProtScale、SignalP-5.0、TMHMM2.0、NetPhos3.1、ProtCompv9.0、NetSurfP-2.0和SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息学分析软件分析EgInx的理化特性、信号肽序列、跨膜结构域、磷酸化位点、蛋白翻译后修饰位点及亚细胞定位、二级结构及三级结构;采用BLAST进行蛋白序列的同源性分析,采用Mega7进行系统进化分析。结果EgInx-ORF全长约1317 bp,编码438个氨基酸残基的EgInx蛋白;该蛋白等电点7.19,不稳定系数48.05,为不稳定蛋白;亲水性平均系数0.086,为疏水性蛋白,存在4个跨膜结构域;该蛋白不含信号肽序列,可能是非分泌跨膜蛋白。EgInx具有42个丝氨酸(Ser)磷酸化位点,29个苏氨酸(Thr)磷酸化位点,10个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点;该蛋白有多个翻译后修饰位点,主要定位于细胞膜、高尔基体和线粒体。预测其二级结构以α-螺旋为主,占53.42%;三维结构以八聚体形式组装。EgInx与扁形动物门绦虫纲的多房棘球绦虫(Em)、小口膜壳绦虫(Hm),涡虫纲的东亚三角头涡虫(Dj),吸虫纲的中华枝睾吸虫(Cs)、日本血吸虫(Sj)的Innexin unc 9的氨基酸序列一致性分别为98.14%、58.97%、33.66%、33.11%、33.69%。进化树分析显示,EgInx与Em、Hm的Inx在一个分支上。结论成功克隆了EgInx-ORF,预测EgInx蛋白为疏水性跨膜蛋白,且含有多个磷酸化位点,可为EgInx的功能研究提供参考。

关 键 词:细粒棘球绦虫  内联蛋白  克隆  生物信息学
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