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湖南省1979-2010年狂犬病流行特征及其毒株遗传关系分析
引用本文:蔡亮,高立冬,胡世雄,刘运芝,刘富强,申辛欣,陶晓燕,李浩,刘佳惠,王世清,曾舸,唐青,张红. 湖南省1979-2010年狂犬病流行特征及其毒株遗传关系分析[J]. 疾病控制杂志, 2012, 0(9): 774-777
作者姓名:蔡亮  高立冬  胡世雄  刘运芝  刘富强  申辛欣  陶晓燕  李浩  刘佳惠  王世清  曾舸  唐青  张红
作者单位:[1]湖南省疾病预防控制中心 湖南省微生物分子生物学重点实验室,湖南长沙410005 [2]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 病毒基因工程国家重点实验室,北京102206
基金项目:湖南省卫生厅科研基金(A2007008;B2009-088)
摘    要:目的分析1979-2010年湖南省狂犬病流行特征及分离病毒N基因特征,探讨疫情波动影响因素及病毒进化情况。方法采用回顾性与描述性流行病学方法对湖南省32年来,狂犬病疫情数据进行统计分析;利用PubMed-Entrez Search程序建立GenBank、EMBL报道的湖南省境内分离的狂犬病毒N基因序列本地数据库,应用生物信息学方法分析病毒N基因特征与变异情况,参考贵州与广西2个高发省份分离的部分狂犬病毒及国内疫苗株CTN-1-V N基因序列,运用Clustal W 1.83软件进行多重序列比对,运用MEGA 5.0.4软件构建N基因系统进化树,分析湖南省分离毒株与贵州、广西分离株亲缘关系及病毒遗传特征差异。结果 32年来,湖南省累计报告狂犬病病例12 576例,总发病率0.69/10万;全省124个县(市、区)均有疫情报告;病例集中于湘南与湘中地区;7~10月份发病数较多(43.23%);农民所占比例最大(64.35%)。58株毒株N基因全序列平均GC含量为44.49%,AT含量为55.51%,平均单链分子量为409.7 KDa;氨基酸组成含量最高的为亮氨酸(Leu),含量最低的为色氨酸(Trp);58株毒株与贵州、广西及国内疫苗株有较近亲缘关系;58株病毒全部属于狂犬病毒基因I型。结论 32年来,湖南省狂犬病疫情存在较大波动;所分离的58株毒株遗传较稳定,未发生关键性变异。

关 键 词:狂犬病  流行病学  N基因  计算生物学

Analysis of the epidemiological characteristics and phylogeography of rabies prevalent in Hunan Province, 1979- 2010
CAI Liang,GAO Li-dong,HU Shi-xiong,LIU Yun-zhi,LIU Fu-qiang,SHEN Xin-xin,TAO Xiao-yan,LI Hao,LIU Jia-hui,WANG Shi-qing,ZENG Ge,TANG Qing,ZHANG Hong. Analysis of the epidemiological characteristics and phylogeography of rabies prevalent in Hunan Province, 1979- 2010[J]. Chinese Journal of Disease Control and Prevention, 2012, 0(9): 774-777
Authors:CAI Liang  GAO Li-dong  HU Shi-xiong  LIU Yun-zhi  LIU Fu-qiang  SHEN Xin-xin  TAO Xiao-yan  LI Hao  LIU Jia-hui  WANG Shi-qing  ZENG Ge  TANG Qing  ZHANG Hong
Affiliation:1. Key Laboratory of Microbial Molecular Biology of Hunan Province, Hunan Center for Disease Control and Prevention, Changsha 410005, China; 2. State Key Laboratory for Molecular Virology and Genetic Engineering, Chinese Center for Disease Control and Prevention, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Beijing 102206, China
Abstract:
Keywords:Rabies  Epidemiology  Genotype  Computational biology
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