基于再生数的上海市奥密克戎流行趋势研究

目的 基于截至2022年5月9日上海市奥密克戎(Omicron)的流行趋势，估计封控管理之前的早期再生数(R)以及后续的有效再生数(R_t)变化情况。方法 利用指数增长法、最大似然法和下一代矩阵法估计R,利用贝叶斯方法、时依法和新时变法估计R_t。结果 截至2022年3月29日上海市奥密克戎疫情呈指数增长模式。3种方法估计的R值分别为2.36(95%CI:2.33～2.38),2.14(95%CI:2.11～2.18)和2.29(95%CI:2.22～2.38)。结论 R值较大，上海市早期疫情形势较为严峻。自4月7日起，R_t呈下降趋势，表明封控管理措施有效地减缓了疫情增长。R_t的计算方法中，时依法和新时变法可以较快地响应疫情的动态变化趋势；而贝叶斯法反应较为迟缓，且当报告数据波动较大时，会出现分母为0导致无法计算的情况。