| 不同生态类型菘蓝SLAF-seq分子标记 |
| |
| 引用本文： | 刘东,孟瑾瑾,王盼,陈红刚,王惠珍,杜弢.不同生态类型菘蓝SLAF-seq分子标记[J].中草药,2024,55(7):2375-2382. |
| |
| 作者姓名： | 刘东 孟瑾瑾 王盼 陈红刚 王惠珍 杜弢 |
| |
| 作者单位： | 甘肃中医药大学药学院, 甘肃 兰州 730000 |
| |
| 基金项目： | 国家中药材产业技术体系建设专项资金资助；国家重点研发计划专项“乡村产业共性关键技术研发与集成应用”课题（2022YFD1602105） |
| |
| 摘 要： | 目的 探究不同生态类型菘蓝Isatis tinctoria表型差异和特异位点扩增片段测序（specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq）分子标记。方法 以25个不同生态类型菘蓝为研究对象，利用SLAF-seq技术开发SLAF标签，再结合菘蓝叶片叶表观特征的田间观测，分析不同生态类型菘蓝植株表观差异。结果 测序后各样品所获得的读长总量各不相同，测序质量值Q30为95.66%～96.60%,GC比例为38.13%～41.37%。共开发535 105个菘蓝SLAF标签，多态性SLAF标签有34 412个，共得到63 002个群体单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）标记。测序分析结果与叶表观特征调查结果相结合，可以将25个不同生态类型菘蓝分为5类，分别为倒卵圆形无缺刻皱缩叶、倒卵圆形缺刻皱缩叶、倒卵圆形无缺刻平坦叶、倒卵圆形缺刻平坦叶、披针形无缺刻平坦叶。结论 为后期进一步研究不同类型菘蓝的基因来源和遗传进化提供参考，为菘蓝种质分类、品种鉴定和分子辅助育种提供借鉴。
|
| 关 键 词： | 菘蓝 生态类型 SLAF标签 SNP 群体结构 |
| 收稿时间： | 2023/11/2 0:00:00 |
SLAF-seq molecular markers in different ecological types of Isatis tinctoria |
| |
| LIU Dong,MENG Jinjin,WANG Pan,CHEN Honggang,WANG Huizhen,DU Tao.SLAF-seq molecular markers in different ecological types of Isatis tinctoria[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2024,55(7):2375-2382. |
| |
| Authors: | LIU Dong MENG Jinjin WANG Pan CHEN Honggang WANG Huizhen DU Tao |
| |
| Institution: | College of Pharmacy, Gansu University of Chinese Medicine, Lanzhou 730000, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Isatis tinctoria L ecological type SLAF label SNP population structure |
|
| 点击此处可从《中草药》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《中草药》下载免费的PDF全文 |
|
