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基于网络药理学联合GEO 芯片探讨肾气丸治疗肾小管上皮间质转化的作用机制
引用本文:潘蛟,周小杰,邱璐琦. 基于网络药理学联合GEO 芯片探讨肾气丸治疗肾小管上皮间质转化的作用机制[J]. 新中医, 2022, 54(17): 8-16
作者姓名:潘蛟  周小杰  邱璐琦
作者单位:1. 浙江中医药大学附属第三医院中药药剂科,浙江杭州3100092. 浙江中医药大学中医药科学院,浙江杭州310053
基金项目:2020年浙江中医药大学校级科研基金项目(2020ZZ13)
摘    要:目的:基于网络药理学联合GEO 芯片差异基因分析方法探讨肾气丸治疗肾小管上皮间质转化(EMT) 的作用机制,动物实验进一步验证肾气丸治疗EMT 的作用靶点。方法:依据中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP) 和BATMAN-TCM 数据库筛选出肾气丸的活性成分及其对应靶点,利用GEO 数据库获取疾病相关靶点, 通过Cytoscape3.7.0 软件绘制“ 药物-成分-靶点” 网络。使用STRING 数据库与Cytoscape3.7.0 软件绘制核心靶点蛋白相互作用网络,并利用R 语言对核心靶点进行GO 功能和KEGG 通路富集分析。通过实时荧光定量PCR 验证肾气丸对苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、细胞分裂周期蛋白20(CDC20)、表皮生长因子受体(EGFR)、核受体辅激活蛋白1(NCOA1)、细胞周期蛋白B1(CCNB1) mRNA 的影响。结果:共得到肾气丸活性成分229 个,预测作用靶点共1 331 个,与EMT GEO 芯片共同靶点共221 个。肾气丸治疗EMT 主要作用于AKT1、CDC20、EGFR、NCOA1、CCNB1 等靶点。GO 富集分析涉及到营养物质反应、金属离子反应、氧化应激反应等多种生物过程,KEGG 富集分析得到cAMP 信号通路、钙信号通路、甲状腺激素信号通路、催产素信号通路、HIF-1 信号通路等多条信号通路。实时荧光定量PCR 证明肾气丸治疗可升高腺嘌呤造模小鼠肾组织中AKT1 mRNA 表达,降低CDC20、EGFR 和CCNB1 mRNA 表达(P<0.05)。结论:基于网络药理学方法及实验验证,初步阐明肾气丸可通过调节AKT1、CDC20、EGFR、CCNB1 mRNA 表达来改善EMT,其作用机制可能与cAMP 信号通路、钙信号通路等多条信号通路有关。

关 键 词:肾小管上皮间质转化;肾气丸;网络药理学;GEO 芯片;作用机制

Discussion on Mechanism of Shenqi Pills for Epithelial-Mesenchymal Transformationof Renal Tubules Based on Network Pharmacology and GEO Chip
PAN Jiao,ZHOU Xiaojie,QIU Luqi. Discussion on Mechanism of Shenqi Pills for Epithelial-Mesenchymal Transformationof Renal Tubules Based on Network Pharmacology and GEO Chip[J]. JOURNAL OF NEW CHINESE MEDICINE, 2022, 54(17): 8-16
Authors:PAN Jiao  ZHOU Xiaojie  QIU Luqi
Abstract:
Keywords:
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