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基于GEO和TCGA数据筛选和鉴定食管鳞状细胞癌关键枢纽基因
作者姓名:刘蓉  黄伟  王磊
作者单位:吉首大学生物资源与环境科学学院,湖南 吉首 416000;中南大学湘雅医院,湖南 长沙 410008;中南大学基础医学院,湖南 长沙 410008
摘    要:[目的]基于GEO和TCGA数据库中的食管鳞状细胞癌的转录组数据,利用生物信息学方法筛选和鉴定食管鳞状细胞癌的关键枢纽基因.[方法]下载GEO中食管鳞状细胞癌数据集GSE17351和TCGA中的食管鳞状细胞癌RNA-seq数据,利用R软件Limma程序包筛选差异表达基因;利用ClusterProfiler程序包对差异基...

关 键 词:癌,鳞状细胞  食管肿瘤  基因表达调控,肿瘤  遗传学技术
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