| 2009~2012年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA与NA基因的进化分析 |
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| 引用本文： | 吴英萍,崔大伟,秦志梅,谢国良,杨先知,郑书发,余斐,范剑,陈瑜.2009~2012年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA与NA基因的进化分析[J].临床检验杂志,2013,31(4):272-275. |
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| 作者姓名： | 吴英萍 崔大伟 秦志梅 谢国良 杨先知 郑书发 余斐 范剑 陈瑜 |
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| 作者单位： | 浙江大学医学院附属义乌医院检验科，浙江义乌321000;浙江大学医学院附属第一医院检验科，杭州310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科，杭州310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科，杭州310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科，杭州310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科，杭州310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科，杭州310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科，杭州310003;浙江大学医学院附属第一医院检验科，杭州310003 |
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| 基金项目： | “十二五”国家科技重大专项 （No：2012ZX10004 210）；浙江省教育厅（N20110467）。 |
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| 摘 要： | 摘要：目的：研究杭州地区2009年至2012年甲型H1N1流感病毒血凝素（HA）与神经氨酸酶（NA）的基因进化特征,分析该病毒的遗传变异和抗原的分子水平转变。 方法：用RT-PCR分别扩增甲型H1N1流感病毒HA基因和NA基因片段并进行测序，用DNAMAN和MEGA 4.0生物信息学软件对HA和NA基因序列进行进化分析。 结果：建立的RT-PCR可成功检测HA(C)、HA(D)和NA基因，遗传进化分析结果表明，杭州地区甲型H1N1流感病毒的HA与NA氨基酸序列的亲缘系数与WHO推荐的病毒株及国内代表株的同源性均为98.9%~100%；三维构象结果表明，HA编码的蛋白质有5个位点发生改变，而NA编码的蛋白质仅发生2个位点改变。 结论：2009年至2011年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA和NA基因序列与世界范围内流行的病毒参考株具有高度同源性，但HA与NA蛋白质表位存在某些氨基酸位点的改变。
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| 关 键 词： | 甲型H1N1流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 建模 |
| 收稿时间： | 2012/10/19 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2/7/2013 12:00:00 AM |
Evolution analysis of HA and NA genes of influenza A (H1N1) virus in Hangzhou region during 2009~2011 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | influenza A (H1N1) virus hemagglutinin neuraminidase modeling |
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