| 生物信息学在新基因HCA520研究中的作用 |
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| 引用本文： | 杨美香,曲迅,韩克军,冯进波,陈慰峰.生物信息学在新基因HCA520研究中的作用[J].药物生物技术,2004,11(4):216-220. |
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| 作者姓名： | 杨美香 曲迅 韩克军 冯进波 陈慰峰 |
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| 作者单位： | 1. 山东大学齐鲁医院临床基础研究所,山东,济南,250012
2. 北京大学医学部免疫学系,北京,100083 |
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| 基金项目： | 国家“973”基金资助项目 (No .G19990 5 3 90 4)，北京市自然科学基金资助项目 (No .70 0 10 0 2 ) |
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| 摘 要： | 利用生物信息学对新基因HCA520的基因和蛋白序列进行分析，探讨生物信息学在新基因研究中的作用。以人类基因组数据库为基础，利用电子PCR和SAGE对HCA520进行染色体定位和组织表达分布分析；BLAST程序进行HCA520的基因结构分析和相似序列搜索；ORF finder和Gene Runner3.05程序对HCA520编码蛋白进行序列预测和功能分析。RT-PCR检测HCA520的组织表达谱。通过以上分析得出HCA520的全长cDNA为2396bp，定位于染色体16p12.2，其最长的开放读码框架为591bp，编码196个氨基酸。编码氨基酸含有典型的EF-hand保守序列，与CHP具有很高的同源性，为一胞内蛋白。在多种组织中有表达。提示HCA520可能是新的钙离子结合蛋白家族成员，可能通过调节Na^ /H^ 交换子的活性影响细胞的生物学功能。
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| 关 键 词： | 生物信息学 功能研究 HCA520 |
| 文章编号： | 1005-8915(2004)04-0216-05 |
The Application of Bioinformatics in Studying the Novel Gene HCA520 |
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| YANG Mei-xiang ,QU Xun ,HAN Ke-jun ,FENG J in-bo ,CHEN Wei-feng.The Application of Bioinformatics in Studying the Novel Gene HCA520[J].Pharmaceutical Biotechnology,2004,11(4):216-220. |
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| Authors: | YANG Mei-xiang QU Xun HAN Ke-jun FENG J in-bo CHEN Wei-feng |
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| Institution: | YANG Mei-xiang 1,2,QU Xun 1,HAN Ke-jun 2,FENG J in-bo 1,CHEN Wei-feng 2 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Bioinformatics Functional analysis HCA520 |
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