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基于网络药理学探讨半夏治疗直肠癌的作用机制
引用本文:俞艳艳,沈忠,张秀峰,黄丹丹. 基于网络药理学探讨半夏治疗直肠癌的作用机制[J]. 浙江中医药大学学报, 2020, 44(8): 783-789, 806
作者姓名:俞艳艳  沈忠  张秀峰  黄丹丹
作者单位:杭州市第三人民医院 杭州 310002
基金项目:杭州市卫生计生科技计划一般项目(2017A26)
摘    要:[目的]分析半夏的有效活性化合物及其对直肠癌靶点的作用机制。[方法]应用中药系统药理数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选出半夏中的潜在化学活性物质及相关靶点蛋白,采用基因组注释数据库平台(genome annotation database platform,Gene Cards)预测直肠癌的作用靶点,并运用Uniprot数据库查询与之相对应的基因名称,借助Cytoscape 3.7.2软件,构建“药物-疾病-靶点”的网络图,通过String数据库平台构建蛋白间相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,再利用Bioconductor平台和R语言(The R programming language)进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。[结果]通过筛选,共获得半夏的有效化学成分13个,与直肠癌相关的关键化学成分10个,半夏-直肠癌的共同靶点32个,获得15个PPI核心基因;获得GO生物学过程66条和KEGG相关信号通路104条,涉及乙肝通路、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒感染通路、小细胞肺癌通路、细胞凋亡通路、麻疹通路、人类免疫缺陷病毒1感染通路、大肠癌通路、EB病毒感染通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、p53信号通路、铂剂耐药通路、白细胞介素-17(interleukin-17, IL-17)信号通路、前列腺癌通路等。[结论]半夏可以通过多种途径对直肠癌产生疗效,此为未来提取半夏治疗直肠癌的有效成分奠定了基础。

关 键 词:网络药理学;半夏;直肠癌;生物信息技术;系统药理学;靶点基因;信号通路;作用机制
收稿时间:2020-03-06

Explore the Mechanism of Rhizoma Pinelliae in Treating Rectal Cancer Based on Network Pharmacology
YU Yanyan,SHEN Zhong,ZHANG Xiufeng. Explore the Mechanism of Rhizoma Pinelliae in Treating Rectal Cancer Based on Network Pharmacology[J]. Journal of Zhejiang University of Traditional Chinese Medicine, 2020, 44(8): 783-789, 806
Authors:YU Yanyan  SHEN Zhong  ZHANG Xiufeng
Abstract:
Keywords:network pharmacology   Rhizoma pinelliae   rectal cancer   bioinformatics   systems pharmacology   target genes   signaling pathways   mechanism of action
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