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山茱萸萜类合成途径关键酶HMGR1基因的克隆与分析
引用本文:李志红,段佩玲,徐静雅,杨萌萌,段姗姗,侯小改,侯典云.山茱萸萜类合成途径关键酶HMGR1基因的克隆与分析[J].中草药,2020,51(18):4733-4738.
作者姓名:李志红  段佩玲  徐静雅  杨萌萌  段姗姗  侯小改  侯典云
作者单位:河南科技大学农学院, 河南 洛阳 471023;洛阳市道地药材繁育与创新利用工程技术研究中心, 河南 洛阳 471023;郑州铁路职业技术学院药学院 郑州 450000
基金项目:国家自然科学基金项目(U1404829);中央本级重大增减支项目“名贵中药资源可持续利用能力建设项目”(2060302);河南省中药产业技术体系建设专项资金;棉花生物学重点实验室开放课题资助(CB2020A24)
摘    要:目的克隆山茱萸Cornus officinalis HMGR1的cDNA序列并进行生物信息学分析。方法以山茱萸转录组数据中unigenec100572_g1序列为参考,在其开放阅读框两端设计特异引物,经实时荧光定量PCR(RT-PCR)扩增、连接pTOPO-T载体克隆并测序,获得CoHMGR1基因的cDNA序列,并利用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白进行相关分析。结果 CoHMGR1基因长2 116 bp,含长度为1 338 bp的完整开放阅读框(ORF),编码445个氨基酸,为疏水性蛋白。多序列比对和亲缘关系分析显示,CoHMGR1基因编码的氨基酸序列与喜树的序列相似性较高,达79.56%。结论首次对山茱萸叶片和果实进行比较转录组测序的基础上,成功克隆并分析了CoHMGR1基因,为进一步研究CoHMGR1蛋白的功能及山茱萸萜类合成途径的分子机制奠定基础。

关 键 词:山茱萸|萜类|CoHMGR1|克隆|实时荧光定量PCR|序列分析
收稿时间:2020/2/9 0:00:00

Cloning and analysis of a key enzyme of HMGR1 gene involved in terpene biosynthesis of Cornus officinalis
LI Zhi-hong,DUAN Pei-ling,XU Jing-y,YANG Meng-meng,DUAN Shan-shan,HOU Xiao-gai,HOU Dian-yun.Cloning and analysis of a key enzyme of HMGR1 gene involved in terpene biosynthesis of Cornus officinalis[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2020,51(18):4733-4738.
Authors:LI Zhi-hong  DUAN Pei-ling  XU Jing-y  YANG Meng-meng  DUAN Shan-shan  HOU Xiao-gai  HOU Dian-yun
Institution:Agricultural College, Henan University of Science and Technology, Luoyang 471023, China;The Luoyang Engineering Research Center of Breeding and Utilization of Dao-di Herbs, Luoyang 471023, China;College of pharmacy, Zhengzhou Railway Vocational Technical College, Zhengzhou 450000, China
Abstract:
Keywords:Cornus officinalis Sieb  et Zucc  |terpene|CoHMGR1|cloning|RT-PCR|sequence analysis
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