| 分子对接结合网络药理学研究桂枝芍药知母汤治疗类风湿关节炎的分子作用机制 |
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| 引用本文： | 张青,徐月,彭伟,刘佳,李若兰,邓婷,高永翔,蒲旭峰. 分子对接结合网络药理学研究桂枝芍药知母汤治疗类风湿关节炎的分子作用机制[J]. 中草药, 2020, 51(18): 4673-4684 |
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| 作者姓名： | 张青 徐月 彭伟 刘佳 李若兰 邓婷 高永翔 蒲旭峰 |
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| 作者单位： | 成都中医药大学药学院, 四川 成都 611137;成都中医药大学附属医院, 四川 成都 610072;成都中医药大学基础医学院, 四川 成都 611137;成都中医药大学药学院, 四川 成都 611137;成都市食品药品检验研究院, 四川 成都 610000 |
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| 基金项目： | 国家科技重大专项课题（2018ZX09721004-009-002） |
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| 摘 要： | 目的利用分子对接和网络药理学的方法预测桂枝芍药知母汤治疗类风湿关节炎的主要活性成分和作用靶点,结合中医方解配伍理论对其多成分-多靶点-多通路的作用进行分析。方法在TCMSP、TCM-Datebase@Taiwan、PubChen Compound数据库收集桂枝芍药知母汤中9味中药(桂枝、芍药、知母、甘草、麻黄、生姜、白术、防风、附子)的主要化学成分。通过DrugBank、TTD数据库查找与类风湿关节炎治疗相关的蛋白靶点,并上传到String在线数据库,构建蛋白互作网络关系。在PDB数据库下载合适的蛋白靶点晶体结构,采用Discovery studio 4.5.0软件进行化合物与靶点的分子对接,利用Cytoscape 3.6.1软件,构建药物-化合物-靶点可视化网络,阐释桂枝芍药知母汤抗类风湿关节炎的主要作用机制。结果分子对接结果显示桂枝芍药知母汤中存在316个潜在的抗关节炎活性成分,作用于26个靶点,其中MAPK1、ZADH2、P38、AKR1C2、DHODH、CA2、MMP3、MMP9、RANKL等蛋白是主要作用靶点。生物功能和通路分析提示,桂枝芍药知母汤的作用机制主要涉及骨吸收(28%)、组蛋白激酶活性(20%)、肽基酪氨酸磷酸化(20%)、前列腺素代谢过程(12%)等生物过程。作用通路主要是破骨细胞的分化(94.12%)。结论采用分子对接结合网络药理学的方法,从多靶点多途径的角度研究桂枝芍药知母汤治疗类风湿关节炎的药效物质基础及分子机制,为更好的临床用药提供参考和依据。
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| 关 键 词： | 桂枝芍药知母汤|类风湿关节炎|分子对接|网络药理学|作用机制|作用靶点|桂枝|芍药|知母|甘草|麻黄|生姜|白术|防风|附子 |
| 收稿时间： | 2019-07-12 |
Molecular docking combined with network pharmacology to study molecular mechanism of Guizhi Shaoyao Zhimu Decoction in treatment of rheumatoid arthritis |
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| ZHANG Qing,XU Yue,PENG Wei,LIU Ji,LI Ruo-lan,DENG Ting,GAO Yong-xiang,PU Xu-feng. Molecular docking combined with network pharmacology to study molecular mechanism of Guizhi Shaoyao Zhimu Decoction in treatment of rheumatoid arthritis[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2020, 51(18): 4673-4684 |
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| Authors: | ZHANG Qing XU Yue PENG Wei LIU Ji LI Ruo-lan DENG Ting GAO Yong-xiang PU Xu-feng |
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| Affiliation: | School of Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu 611137, China;Hospital of Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu 610072, China;School of Basic Medical Sciences, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu 611137, China; School of Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu 611137, China;Chengdu Municipal Institute for Food and Drug Control, Chengdu 610000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Guizhi Shaoyao Zhimu Decoction|rheumatoid arthritis|molecular docking|network pharmacology|mechanism of action|target of action|Cinnamomi Ramulus|Paeoniae Radix Alba|Anemarrhenae Rhizoma|Glycyrrhizae Radix et Rhizoma|Ephedrae Herba|Zingiberis Rhizoma Recens|Atractylodis Macrocephalae Rhizoma|Saposhnikoviae Radix|Aconiti Lateralis Radix Praeparata |
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