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地涌金莲O-甲基转移酶基因的克隆与表达分析
引用本文:吴君芝,林谷音,王帆,李丕睿,吕威,赵万里,陈雨. 地涌金莲O-甲基转移酶基因的克隆与表达分析[J]. 中草药, 2024, 55(15): 5212-5221
作者姓名:吴君芝  林谷音  王帆  李丕睿  吕威  赵万里  陈雨
作者单位:南京中医药大学, 江苏 南京 210023;江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园), 江苏 南京 210014
基金项目:国家自然科学基金面上项目(3207020751)
摘    要:目的 克隆地涌金莲Musella lasiocarpaO-甲基转移酶(O-methyltransferase,OMT)基因,并对其进行生物信息学及表达模式分析。方法 基于地涌金莲转录组数据,筛选并原核表达了3条MlOMTs酶基因(MlOMT1MlOMT2MlOMT3)。利用软件对其进行生物信息学分析,利用MEGA11构建系统发育树,采用实时荧光定量PCR检测基因表达模式。结果 PCR扩增得到3条MlOMTs基因;3个MlOMT蛋白长度为289~400个氨基酸,相对分子质量在3 147 360~4 526 756,3个蛋白均为不稳定的亲水性蛋白,其中MlOMT1和MlOMT2不含跨膜区,MlOMT3存在2个跨膜螺旋,其N端位于胞质内。3个蛋白主要定位于叶绿体,不含有信号肽,主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,含有SAM依赖的甲基转移酶超家族的保守结构域,属于SAM依赖的甲基转移酶超级家族。系统进化分析表明,MlOMT1与来源于大麦Hordeum vulgare的Hv7OMT和粳稻Oryza sativa subsp. japonica的OsOMT17聚为一支,MlOMT2与冰叶日中花Mesembryanthemum crystallinum的McPFOMT聚为一支,而MlOMT3与拟南芥Arabidopsis thaliana的AtCCoAOMT1聚为一支,表明它们亲缘关系较近,推测它们具有类似的生物学功能。通过对表达条件的初步优化,重组工程菌pMal-c4X-MlOMT1和pMal-c4X-MlOMT2在大肠杆菌BL21(DE3)中实现蛋白可溶性表达。组织特异性表达分析结果显示,MlOMT1在地涌金莲不同组织相对表达量为:叶片>苞片>种子,MlOMT2MlOMT3相对表达量为:苞片>种子>叶片。结论 成功克隆获得地涌金莲3条MlOMTs基因并进行生物信息学分析和原核表达,为后续酶的功能表征奠定基础。

关 键 词:地涌金莲  甲基转移酶  基因克隆  实时荧光定量PCR  生物信息学分析
收稿时间:2024-03-18

Cloning and expression analysis of O-methyltransferase genes in Musella lasiocarpa
WU Junzhi,LIN Guyin,WANG Fan,LI Pirui,LYU Wei,ZHAO Wanli,CHEN Yu. Cloning and expression analysis of O-methyltransferase genes in Musella lasiocarpa[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2024, 55(15): 5212-5221
Authors:WU Junzhi  LIN Guyin  WANG Fan  LI Pirui  LYU Wei  ZHAO Wanli  CHEN Yu
Affiliation:Nanjing University of Chinese Medicine, Nanjing 210023, China;Jiangsu Province and Chinese Academy of Sciences (Nanjing Botanical Garden Mem. Sun Yat-Sen), Nanjing 210014, China
Abstract:
Keywords:Musella lasiocarpa (Franch.) C. Y. Wu ex H. W. Li  methyltransferase  gene cloning  quantitative real-time PCR  bioinformatics analysis
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