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调控甘松中倍半萜类化合物积累的转录因子分析
引用本文:何斌,曲别阿香,李敏,罗梦婷,青贤,刘十祎,苏琪,李莹,陈晨,刘圆,阎新佳,李文兵,张绍山. 调控甘松中倍半萜类化合物积累的转录因子分析[J]. 中草药, 2024, 55(15): 5222-5229
作者姓名:何斌  曲别阿香  李敏  罗梦婷  青贤  刘十祎  苏琪  李莹  陈晨  刘圆  阎新佳  李文兵  张绍山
作者单位:西南民族大学药学院, 四川 成都 610041;四川省羌彝药用资源保护与利用技术工程实验室, 四川 成都 610225;青藏高原民族药用资源保护与利用国家民委重点实验室, 四川 成都 610225;四川香原珍稀中药科技开发有限公司, 四川 马尔康 624011
基金项目:四川省自然科学基金资助项目(24ZDYF1401);四川省药品检验研究院/国家药品监督管理局中成药质量评价重点实验室开放课题资助(中成药-2024-KFKT-001);中央高校基本科研业务费专项资金研究类项目(2023NYXXS082)
摘    要:目的 筛选参与调控甘松Nardostachys jatamansi主要活性倍半萜类化合物积累的bHLH、bZIP、MYB家族转录因子。方法 利用甘松全长转录组数据库注释信息获取bHLH、bZIP、MYB家族转录因子,利用WGCNA分析潜在能正向调控主要倍半萜类化合物积累的转录因子,利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymeras chain reaction,qRT-PCR)进一步确认候选转录因子是否影响甘松主要活性倍半萜类化合物的积累,利用MEME在线网站分析候选bHLH、bZIP、MYB基因家族成员的保守基序。结果 在甘松全长转录组数据中分别筛选出bHLH家族893个、bZIP家族416个、MYB家族436个,WGCNA分析筛选能正向调控萜类化合物生物合成的转录因子共458个,qRT-PCR确认候选转录因子的表达水平与甘松主要活性倍半萜化合物的积累水平高度正相关。结论 甘松主要倍半萜类化合物的积累可能受到本研究筛选的458个转录因子的正向调控作用,可作为甘松主要药效物质生物合成调控机制研究的潜在靶基因。

关 键 词:甘松  转录因子  WGCNA  qRT-PCR  倍半萜类
收稿时间:2024-01-02

Analysis of transcription factors regulating accumulation of sesquiterpenoids in Nardostachys jatamansi
HE Bin,QUBIE Axiang,LI Min,LUO Mengting,QING Xian,LIU Shiyi,SU Qi,LI Ying,CHEN Chen,LIU Yuan,YAN Xinji,LI Wenbing,ZHANG Shaoshan. Analysis of transcription factors regulating accumulation of sesquiterpenoids in Nardostachys jatamansi[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2024, 55(15): 5222-5229
Authors:HE Bin  QUBIE Axiang  LI Min  LUO Mengting  QING Xian  LIU Shiyi  SU Qi  LI Ying  CHEN Chen  LIU Yuan  YAN Xinji  LI Wenbing  ZHANG Shaoshan
Affiliation:College of Pharmacy, Southwest Minzu University, Chengdu 610041, China;Sichuan Technology and Engineering Laboratory of QiangYi Medicinal Resources Protection and Utilization, Chengdu 610225, China;Key Laboratory of Tibetan Plateau Ethnic Medicinal Resources Protection and Utilization of National Ethnic Affairs Commission, Chengdu 610225, China;Sichuan Xiangyuan Rare Chinese Medicine Technology Development Co., Ltd., Maerkang 624011, China
Abstract:
Keywords:
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