基于HER-2相关基因构建风险模型用于膀胱癌生存预后评估 |
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引用本文: | 刘欢锐,彭祥,李森林,苟欣.基于HER-2相关基因构建风险模型用于膀胱癌生存预后评估[J].北京大学学报(医学版),2023(5):793-801. |
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作者姓名: | 刘欢锐 彭祥 李森林 苟欣 |
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作者单位: | 1. 重庆医科大学附属第一医院泌尿外科;2. 分子肿瘤与表观遗传学重庆市重点实验室 |
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摘 要: | 目的:探讨HER-2相关基因(the human epidermal growth factor receptor-2-related genes, HRGs)与膀胱癌生存预后的相关性,并基于HRGs构建一种膀胱癌患者生存预后的预测模型。方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)中下载膀胱肿瘤组织mRNA测序数据和临床数据,通过与分子签名数据库(the molecular signatures database, MSigDB)中HER-2相关的基因联合分析鉴定膀胱癌中的HRGs。利用单因素和多因素Cox回归分析进一步明确与膀胱癌生存相关的HRGs(P<0.05),并构建HRGs风险模型(HRGs risk score model, HRSM),根据风险评分取中位数将膀胱癌患者分成高风险组和低风险组。利用R语言对高风险和低风险组的患者进行生存分析,并对HRGs与临床特征的相关性进行分析。利用多因素Cox回归分析,验证影响膀胱癌患者预后的独立因素。计算HRSM的受试者工作特征曲线(receiver operating characteris...
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关 键 词: | 膀胱癌 HER-2相关基因 风险模型 预后 免疫细胞浸润 |
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