舌鳞状细胞癌关键基因的筛选及其潜在治疗药物的预测 |
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引用本文: | 苏萌,凌小芳,张钊银,姚金光.舌鳞状细胞癌关键基因的筛选及其潜在治疗药物的预测[J].医学研究杂志,2023,52(3):32-38. |
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作者姓名: | 苏萌 凌小芳 张钊银 姚金光 |
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作者单位: | 右江民族医学院口腔医学院,百色 533000 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(81660495);广西壮族自治区研究生教育创新计划项目(YCSW2022459) |
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摘 要: | 目的 通过生物信息学方法筛选舌鳞状细胞癌的关键基因,并预测其潜在的治疗药物。方法 从GEO数据库中下载GSE34105和GSE13601数据集,并利用limma包筛选DEGs。DAVID数据库对DEGs进行GO及KEGG富集分析。STRING数据库构建PPI网络,并在Cytoscape中进行可视化。“CytoHubba”筛选Hub基因,并利用TCGA数据库、HPA数据库及RT-qPCR进行验证。最后,在Cellminer数据库中筛选Hub基因潜在的治疗药物。结果 共筛选出192个DEGs,其中上调基因84个,下调基因108个。GO富集分析显示,DEGs主要涉免疫反应、细胞外基质分解等生物学过程;KEGG富集分析显示,DEGs主要富集在EMC-受体相互作用信号通路。筛选出IFIT3、OAS2作为Hub基因。预测出布加替尼、艾沙佐米柠檬酸盐及硼替佐米等19种可能靶向作用于舌鳞状细胞癌的药物。结论 通过生物信息学方法筛选出两个Hub基因,并预测其潜在的治疗药物,为研究舌鳞状细胞癌的分子机制及开发治疗药物提供理论基础。
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关 键 词: | 舌鳞状细胞癌 生物学标志物 关键基因 分子对接 |
收稿时间: | 2022/5/3 0:00:00 |
修稿时间: | 2022/5/11 0:00:00 |
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