生物信息学分析CHD3在卵巢癌中的作用

目的 本研究利用生物信息学分析CHD3基因在卵巢癌中的临床作用，探究卵巢癌的潜在肿瘤标志物。方法 通过Oncomine数据库检测健康卵巢样品和卵巢癌组织中CHD基因家族的mRNA表达，Kaplan-Meier plotter评估了卵巢癌患者的CHD3的预后值，并利用多种工具分析了与CHD3相关的临床作用，如突变、卵巢癌的临床分期、免疫亚型、药物敏感度和m⁶A相关基因等。利用R软件对CHD3的GSEA基因富集分析进行了分析。结果 卵巢癌患者的CHD3mRNA表达水平显著上调，且高表达CHD3mRNA水平在卵巢癌患者中显示出较好的总生存期和无进展生存期。此外，CHD3的表达水平在免疫亚型等方面比较，差异有统计学意义。CHD3与具有甲基转移酶(METL16、RBM15B)和RNA结合蛋白(YTHDC1)的调节相关基因呈显著正相关，CHD3的表达可考虑确定NSC319726化疗药物在卵巢癌患者中的治疗效果。最后，CHD3可能涉及通过Notch信号通路影响卵巢癌的发展。结论 CHD3基因可能是诊断卵巢癌和影响预后的肿瘤标志物。