| Visfatin转录调控的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 曾建涛,王继红. Visfatin转录调控的生物信息学分析[J]. 重庆医科大学学报, 2008, 33(3): 334-336 |
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| 作者姓名： | 曾建涛 王继红 |
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| 作者单位： | 重庆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,重庆,400016;重庆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,重庆,400016 |
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| 摘 要： | 目的:分析Visfatin基因可能的转录启动子区段及转录因子结合位点.方法:检索网上数据库资料,获得Visfatin的转录本信息;运用CpG/CpGReport/Isochore和FirstEF对Visfatin基因进行CpG岛分析和第一外显子预测;利用PromoterScan等程序对Visfatin的启动子进行预测.再用Matlspector、TFSEARCH和Match预测潜在的调控元件及转录因子结合位点.结果:目前已知的Visfatin转录本中,5'UTR区最长的序列为NM_005746;Visfatin基因属于典型的CpG岛相关基因,在NM_005746的5'上游229bp到798bp内很可能存在启动子,在该区域内发现了一些重要的顺式作用元件.结论:NM_005746的5'上游229bp到798bp内存在一些重要的顺式作用元件,通过实验确认这些转录因子结合位点有重要意义.
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| 关 键 词： | Visfatin 转录调控 生物信息学 |
| 文章编号： | 0253-3626(2008)03-0334-03 |
| 修稿时间： | 2007-09-13 |
Bioinformatics analysis of the transcriptional regulation of Visfatin |
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| ZENG Jian-tao. Bioinformatics analysis of the transcriptional regulation of Visfatin[J]. Journal of Chongqing Medical University, 2008, 33(3): 334-336 |
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| Authors: | ZENG Jian-tao |
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