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| B19微小病毒70-mer寡核苷酸探针的设计 | |
| 引用本文： | 刘佳,郑文岭,马文丽.B19微小病毒70-mer寡核苷酸探针的设计[J].山西医科大学学报,2004,35(2):104-106. |
| 作者姓名： | 刘佳 郑文岭 马文丽 |
| 作者单位： | 1. 第一军医大学分子生物学研究所,广州,510515;广州军区总医院分子肿瘤学研究所 2. 广州军区总医院分子肿瘤学研究所 3. 第一军医大学分子生物学研究所,广州,510515 |
| 基金项目： | 广州市重大科技攻关项目 (No .99 Z 0 2 2 0 1) |
| 摘 要： | 目的 设计B19微小病毒诊断基因芯片的寡核苷酸探针。方法 以微小病毒B19为例 ,利用BLAST软件对其序列进行比对并获得特异序列 ;利用软件Oligo 6设计特异性高、Tm值接近、长度均一的寡核苷酸探针。 结果 获得 12条 70 mer寡核苷酸探针 ,用于芯片打印及病毒检测。结论 利用BLAST系统和生物学软件Oligo 6可简便而有效地设计诊断芯片探针 |
| 关 键 词： | 寡核苷酸序列分析 寡核苷酸探针 BLAST |
| 文章编号： | 1007-6611(2004)02-0104-03 |
| 修稿时间： | 2003年12月10 |
Design of 70-mer oligonucleotide probes for microarray detection |
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| LIU Jia,ZHENG Wen-ling,MA Wen-li.Design of 70-mer oligonucleotide probes for microarray detection[J].Journal of Shanxi Medical University,2004,35(2):104-106. | |
| Authors: | LIU Jia ZHENG Wen-ling MA Wen-li |
| Abstract: | Objective To design oligo probes for microarray detection of parvovirus B19. Methods By analyzing DNA sequence of human parvovirus B19 with BLAST program. A group of specific sequences as candidate regions were located. Then Oligo software was applied to select probes with high specificity, identical length and similar melting temperature (Tm). Results Twelve oligoprodbes were designed, which will be deposited on chips as a microarray for detection. Conclusion It is an effective method to design oligo probes by BLAST program and Oligo 6 software for human parvovirus B19 diagnosis. |
| Keywords: | oligonucleotide array sequence analysis oligonucleotide probes BLAST |
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