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坏死性凋亡相关的长链非编码RNAs生物标志物预测肝细胞癌预后模型的构建
作者姓名:黄琼庆  梁珍贵  黄琪琪  欧超
作者单位:广西医科大学附属肿瘤医院检验科
基金项目:广西重点研发计划项目(桂科AB19110007);;广西自然科学基金项目(2017GXNSFAA198015);;广西研究生教育创新计划项目(YCSW2023215);
摘    要:目的 构建基于坏死性凋亡相关的长链非编码RNAs(necroptosis-related long non-coding RNAs,NRLs)的肝细胞癌预后模型。方法 从TCGA数据库下载肝细胞癌的转录本数据和临床信息。采用LASSO-Cox模型构建预后预测模型,受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线和校准曲线评估该模型的预测价值,并进行基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)和免疫浸润分析。qRT-PCR验证4个NRLs在肝细胞癌细胞Huh7和正常肝细胞MIHA中的差异表达。结果 本研究构建了基于AL117336.2、MKLN1-AS、FOXD2-AS1、LINC01224等4个NRLs的肝细胞癌风险预后模型。基于训练集构建的风险评分是预后的独立影响因素(HR=1.275,P<0.001)。在训练集中,风险模型预测1、3、5年OS的AUC分别为0.816、0.747、0.752,在测试集中分别为0.713、0.621、0.626,且校准曲线显示模型有较好的一致性。根据中位风险评...

关 键 词:肝细胞癌  坏死性凋亡  长链非编码RNAs(lncRNAs)  预后
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