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HIV-1B′亚型毒株新型耐药相关突变位点的筛选
引用本文:李韩平,郭伟,刘永健,鲍作义,李林,庄道民,刘思扬,王铮,王晓林,李敬云. HIV-1B′亚型毒株新型耐药相关突变位点的筛选[J]. 中华流行病学杂志, 2010, 32(12): 499-503. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2011.05.018
作者姓名:李韩平  郭伟  刘永健  鲍作义  李林  庄道民  刘思扬  王铮  王晓林  李敬云
作者单位:军事医学科学院微生物流行病研究所,病原微生物生物安全国家重点实验室,北京,100071;
基金项目:国家自然科学基金"十一五"国家科技重大专项,
摘    要:目的 筛选HIV-1 B′亚型病毒株中可能存在的新型耐药相关突变位点.方法 收集整理前期研究获得的451条HIV-1B′亚型pol区基因序列,序列含蛋白酶全长(1~99个密码子)和反转录酶全长(1~560个密码子),长度约1977 bp.将354条来自接受抗病毒治疗艾滋病患者的(服药组)序列与97条来自未接受治疗患者的(未服药组)序列,分别与B亚型野生型pol基因共享序列进行逐个密码子比对,筛选在服药组序列中出现的频率显著高于未服药组序列的突变位点,将筛选出来的突变位点在斯坦福大学HIV-1耐药数据库中检索,根据数据库收录的情况及解释,初步分析突变与耐药的关系.结果 在服药组序列中反转录酶区有6个位点7个突变的频率显著高于未服药组,分别是D123E、V292I、K366R、T369A、T369V、A371V和1375V,即前2个突变位于反转录酶的聚合酶区、后5个突变位于反转录酶的连接区.检索数据库收录情况,有7个突变均为相应位点的主要变异形式,在服药患者中出现的频率显著高于未服药患者.结论 筛选出的HIV-1 B′亚型病毒株7个突变可能与耐药有关.

关 键 词:B′亚型   新型耐药突变   

Screening program on novel drug resistance mutations of subtype B' in human immunodeficiency virus type 1 in China
LI Han-ping,GUO Wei,LIU Yong-jian,BAO Zuo-yi,LI Lin,ZHUANG Dao-min,LIU Si-yang,WANG Zheng,WANG Xiao-lin,LI Jing-yun. Screening program on novel drug resistance mutations of subtype B' in human immunodeficiency virus type 1 in China[J]. Chinese Journal of Epidemiology, 2010, 32(12): 499-503. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2011.05.018
Authors:LI Han-ping  GUO Wei  LIU Yong-jian  BAO Zuo-yi  LI Lin  ZHUANG Dao-min  LIU Si-yang  WANG Zheng  WANG Xiao-lin  LI Jing-yun
Abstract:
Keywords:HIV-1HIV-1Subtype B'Novel resistance mutations
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