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人心力衰竭心肌细胞基因表达谱分析方法初探
引用本文:吴晓霞  应晓敏  李伍举  万涛  吴加金  刘惠亮. 人心力衰竭心肌细胞基因表达谱分析方法初探[J]. 中华老年多器官疾病杂志, 2009, 8(6): 544-547
作者姓名:吴晓霞  应晓敏  李伍举  万涛  吴加金  刘惠亮
作者单位:1. 武警总医院心内科,北京市,100039
2. 军事医学科学院基础医学研究所,北京市,100850
3. 解放军总医院肝胆外科,北京市,100853
基金项目:国家自然科学基金资助项目 
摘    要:目的通过对多中心人类心力衰竭心肌细胞基因表达谱数据整理、分析,探索识别不同表达谱中相同结构蛋白基因的方法。方法选取14个已发表的原发病为扩张型心肌病和(或)缺血性心肌病的心力衰竭基因表达谱,筛选出各表达谱中差异表达≥1.4倍的心肌结构蛋白基因及功能蛋白基因。编写程序自动下载相关基因片段的序列,并建立数据库。根据表达谱中提供的识别号及相关注释信息,用BatchGenAna网站在染色体基因组上进行序列定位,通过定位图显示同一基因不同片段的定位信息。结果通过GenBank序号及芯片中克隆序号得到不同表达谱中相同序号的基因仅有23组,检出率低,漏检了相同基因的不同片段。通过染色体基因组比对、定位,检出不同表达谱中定位在同一染色体区域的相同基因的不同片段共51组,且集中定位在1、2、9、11、12、16号染色体上。通过定位明确显示此基因的编码区及调控区序列。结论基因组定位方法可识别不同表达谱中相同基因的不同片段,明确定位基因编码区及调控区,为后续的功能基因组研究提供可靠信息。

关 键 词:心力衰竭  肌细胞  心脏  基因表达谱

Preliminary exploration for a method of analyzing gene expression profiles in myocardium cells of heart failure patients
WU XiaoXi,et al. Preliminary exploration for a method of analyzing gene expression profiles in myocardium cells of heart failure patients[J]. Chinese Journal of Multiple Organ Diseases in the Elderly, 2009, 8(6): 544-547
Authors:WU XiaoXi  et al
Affiliation:WU Xiaoxia,YING Xiaomin,LI Wuju,et alDepartment of Cardiology,General Hospital of Chinese People's Armed Police Forces,Beijing 100039,China
Abstract:
Keywords:heart failure  myocyte  cardiac  gene  expression monitoring
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