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基于高通量测序技术对人参花及其易混淆品鉴定研究
引用本文:王孟虎,孙一帆,许亮,康廷国,左亚锋,翟俊杰,李金洋,孟祥松,汤建,王文建.基于高通量测序技术对人参花及其易混淆品鉴定研究[J].中国现代应用药学,2023,40(14):1950-1956.
作者姓名:王孟虎  孙一帆  许亮  康廷国  左亚锋  翟俊杰  李金洋  孟祥松  汤建  王文建
作者单位:亳州学院, 安徽 亳州 236800;辽宁中医药大学, 辽宁 大连 116600;亳州职业技术学院, 安徽 亳州 236800
基金项目:辽宁省“百千万人才工程”资助项目;安徽高校自然科学研究项目(KJ2021A1143,KJ2020A0765);亳州学院科研项目(BYZXKTD202004,gxbjZD2020095)
摘    要:目的 利用高通量测序技术对人参花及其易混淆品进行鉴定,并利用ITS2测序技术验证高通量测序技术对物种鉴定的准确性。方法 对人参花掺伪样品扩增产物进行高通量测序,使用cutadapt、PEAR、PRINSEQ、Usearch、RDP classifier、SINTAX软件获得分类单元(operational taxonomic unit,OTU)序列,舍弃菌类、unclassified等非绿色植物序列;为避免假阳性情况发生,删除序列数<100条或碱基数<200 bp的OTU序列。对人参花、西洋参花、三七花的ITS2扩增产物进行测序,利用MEGA 11.0对人参花、西洋参花、三七花的ITS2、OTU、GenBank上下载的碱基序列构建邻接法系统聚类树、遗传距离、种间信息位点及对ITS2、OTU碱基序列分别进行Blast分析来验证高通量测序技术对物种鉴定的准确性。通过构建ITS2及OTU碱基序列二级结构对人参花、西洋参花、三七花进行比对分析,根据物种间二级结构的不同对物种进行鉴定。结果 高通量测序共得到54 653条有效序列,人参花、三七花、西洋参花的序列号分别为OTU1、OTU2、OTU3及对应的有效序列分别为31 325,857,442条。通过对各物种的ITS2及OTU碱基序列进行Blast检索,均支持各个物种。人参花与西洋参花、三七花种间遗传距离分别为0.010,0.033,人参花与西洋参花、三七花分别有2,7个信息位点;邻接法系统聚类树显示各个物种均独立聚为一支,其中人参花与西洋参花聚为一大支与三七花并列。人参花与西洋参花二级结构一致,但与三七花在臂Ⅳ及臂Ⅳ与臂Ⅰ之间有A、B、C 3处不同。结论 基于高通量测序技术能够准确鉴定人参花、西洋参花、三七花,对掺伪样品亦具有较强的鉴别能力,为市售人参花样品鉴定提供一定思路。

关 键 词:人参花  西洋参花  三七花  DNA条形码  高通量测序  掺伪粉末
收稿时间:2022/5/24 0:00:00

Study on Identification of Ginseng Flos and its Confounding Products Based on High-throughput Sequencing Technology
WANG Menghu,SUN Yifan,XU Liang,KANG Tingguo,ZUO Yafeng,ZHAI Junjie,LI Jinyang,MENG Xiangsong,TANG Jian,WANG Wenjian.Study on Identification of Ginseng Flos and its Confounding Products Based on High-throughput Sequencing Technology[J].The Chinese Journal of Modern Applied Pharmacy,2023,40(14):1950-1956.
Authors:WANG Menghu  SUN Yifan  XU Liang  KANG Tingguo  ZUO Yafeng  ZHAI Junjie  LI Jinyang  MENG Xiangsong  TANG Jian  WANG Wenjian
Institution:Bozhou University, Bozhou 236800, China;Liaoning University of Traditional Chinese Medicine, Dalian 116600, China;Bozhou Vocational and Technical College, Bozhou 236800, China
Abstract:
Keywords:Ginseng Flos  Quinquefolii Flos  Notoginseng Flos  DNA barcoding  high-throughput sequencing  dulterate powder
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